More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2563 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  100 
 
 		 435 aa  867    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  53.49 
 
 		 435 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  53.76 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  52.68 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  55.84 
 
 		 446 aa  438  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  52.21 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  51.87 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  51.29 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  47.81 
 
 		 435 aa  408  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  51.29 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  48.95 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  51.05 
 
 		 425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  50.82 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  50.35 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  50.82 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  50.82 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  50.82 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  50.82 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  50.82 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  46.15 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  46.96 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  47.02 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  47.02 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  45.87 
 
 		 433 aa  388  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  47.29 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  47.79 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  45.48 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  45.24 
 
 		 428 aa  364  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  46.26 
 
 		 428 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  46.03 
 
 		 428 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  44.29 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  44.7 
 
 		 436 aa  345  8e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  44.08 
 
 		 449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  45.26 
 
 		 451 aa  332  6e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  43.42 
 
 		 433 aa  328  9e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  41.72 
 
 		 438 aa  319  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  44.55 
 
 		 427 aa  315  7e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  42.23 
 
 		 427 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  42.3 
 
 		 427 aa  310  2e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  41.34 
 
 		 431 aa  299  7e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  39.82 
 
 		 478 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  37.79 
 
 		 439 aa  283  3.0000000000000004e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  34.42 
 
 		 488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  37.7 
 
 		 430 aa  260  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  35.01 
 
 		 431 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  36.12 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  36.94 
 
 		 435 aa  253  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  35.35 
 
 		 500 aa  249  7e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  35.97 
 
 		 435 aa  245  9e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  38.68 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  35.25 
 
 		 439 aa  236  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  33.03 
 
 		 433 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  38.11 
 
 		 430 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  31.92 
 
 		 485 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  32.87 
 
 		 461 aa  227  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  33.03 
 
 		 483 aa  226  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  31.9 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  33.33 
 
 		 455 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  33.33 
 
 		 455 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  31.84 
 
 		 435 aa  222  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  31.63 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  37.07 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  34.92 
 
 		 442 aa  219  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  32.31 
 
 		 447 aa  219  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  36.8 
 
 		 429 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  30.63 
 
 		 460 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  36.27 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  31.96 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  32.35 
 
 		 440 aa  212  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  32.02 
 
 		 507 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  31.86 
 
 		 481 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  32.57 
 
 		 448 aa  210  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  30.63 
 
 		 454 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  30.23 
 
 		 463 aa  211  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  32.98 
 
 		 481 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  31.96 
 
 		 447 aa  210  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  31.38 
 
 		 469 aa  209  6e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  31.64 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  30.8 
 
 		 481 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  33.61 
 
 		 482 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  33.61 
 
 		 478 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  33.61 
 
 		 478 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  30.5 
 
 		 471 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  30.88 
 
 		 450 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  29.53 
 
 		 447 aa  206  9e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  32.54 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1894  trigger factor  31.49 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  31.76 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  32.79 
 
 		 479 aa  203  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  34.2 
 
 		 459 aa  202  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  31.47 
 
 		 448 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  31.84 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  29.95 
 
 		 448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18451  trigger factor  30.02 
 
 		 477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  31.54 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf857  trigger factor (prolyl isomerase)  34.99 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  32.18 
 
 		 449 aa  199  7.999999999999999e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  29.15 
 
 		 479 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  31.28 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18641  trigger factor  29.23 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0250835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>