More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2552 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 431 aa  886    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  56.25 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  54.88 
 
 		 459 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  54.73 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  46.67 
 
 		 426 aa  350  3e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  43.72 
 
 		 429 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  42.66 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  39.68 
 
 		 441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  38.93 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  45.73 
 
 		 425 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  40.05 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  39.44 
 
 		 431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  39.63 
 
 		 431 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  38.75 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.05 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  38.57 
 
 		 433 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  37.82 
 
 		 433 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  37.82 
 
 		 433 aa  285  9e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  37.82 
 
 		 433 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  38.3 
 
 		 432 aa  285  9e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  37.59 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  37.82 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  38.59 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.35 
 
 		 433 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.35 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  38.93 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.27 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  35.75 
 
 		 465 aa  277  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  37.78 
 
 		 443 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  36.43 
 
 		 431 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  36.6 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  38.88 
 
 		 424 aa  270  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  39.4 
 
 		 438 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.75 
 
 		 427 aa  264  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  38.85 
 
 		 424 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  38.02 
 
 		 424 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  38.11 
 
 		 434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.87 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  37.24 
 
 		 432 aa  257  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  35.37 
 
 		 451 aa  256  8e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  37.24 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  36.9 
 
 		 437 aa  254  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  34.38 
 
 		 878 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  38.22 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  35.94 
 
 		 453 aa  253  7e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  36.19 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  36.19 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  35.42 
 
 		 422 aa  249  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  35.84 
 
 		 457 aa  249  5e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  35.6 
 
 		 437 aa  247  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  35.57 
 
 		 425 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1720  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 		 423 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1754  FolC bifunctional protein  33.87 
 
 		 423 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.686494  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1227  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.87 
 
 		 421 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113059  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  40.09 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  34.89 
 
 		 810 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  34.97 
 
 		 813 aa  243  6e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  34.5 
 
 		 817 aa  243  7e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  36.92 
 
 		 414 aa  242  7.999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  33.1 
 
 		 422 aa  242  7.999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  36.07 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  35.95 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 		 428 aa  239  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  34.62 
 
 		 438 aa  237  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  34.64 
 
 		 432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  34.29 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  33.56 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  37.38 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  35.71 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  36.47 
 
 		 414 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  34.78 
 
 		 413 aa  233  6e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  34.05 
 
 		 418 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  35.41 
 
 		 428 aa  233  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  36.13 
 
 		 420 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  38.17 
 
 		 448 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  33.72 
 
 		 424 aa  229  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 		 427 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  37.71 
 
 		 452 aa  226  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0591  FolC bifunctional protein  32.84 
 
 		 474 aa  225  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  34.31 
 
 		 447 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  36.47 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  32.57 
 
 		 847 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  34.87 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  37.06 
 
 		 508 aa  223  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  36.11 
 
 		 416 aa  223  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  31.84 
 
 		 840 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  32.37 
 
 		 407 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  33.82 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  36.56 
 
 		 444 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1504  folylpolyglutamate synthase / dihydrofolate synthase  32.64 
 
 		 420 aa  216  8e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000264137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  35.33 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.65 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  33.7 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  32.16 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  37.03 
 
 		 445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  35.4 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  36.03 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  33.48 
 
 		 433 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  36.97 
 
 		 515 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>