More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2545 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  54.65 
 
 
661 aa  751    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
658 aa  1353    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  51.87 
 
 
646 aa  667    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  49.77 
 
 
655 aa  637    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  40.82 
 
 
703 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0540  peptidoglycan glycosyltransferase  38.98 
 
 
689 aa  425  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.725377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  36.11 
 
 
643 aa  422  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  35.93 
 
 
639 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  35.51 
 
 
645 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  34.78 
 
 
647 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  36.98 
 
 
636 aa  398  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4348  penicillin-binding protein 2  36.32 
 
 
697 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.03 
 
 
642 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  35.22 
 
 
625 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 
646 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.58 
 
 
761 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  34.21 
 
 
640 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.52 
 
 
636 aa  348  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  32.86 
 
 
619 aa  348  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  33.48 
 
 
809 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
803 aa  344  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 
645 aa  344  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 
634 aa  343  8e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
802 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
802 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
802 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
802 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  33.33 
 
 
803 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  32.69 
 
 
800 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  33.18 
 
 
802 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  32.64 
 
 
767 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  34.6 
 
 
697 aa  331  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  33.59 
 
 
670 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  36.46 
 
 
709 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  32.13 
 
 
673 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  32.05 
 
 
771 aa  328  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  34.37 
 
 
600 aa  327  5e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 
646 aa  325  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  34.42 
 
 
610 aa  324  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  32.71 
 
 
609 aa  323  8e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  32.56 
 
 
681 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  31.99 
 
 
793 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  32.14 
 
 
801 aa  321  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.23 
 
 
671 aa  321  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  34.36 
 
 
640 aa  321  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  30.52 
 
 
701 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 
635 aa  318  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  34.38 
 
 
605 aa  315  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 
635 aa  314  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 
703 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  32.06 
 
 
801 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  31.74 
 
 
766 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  32.06 
 
 
801 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 
633 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  34.02 
 
 
596 aa  309  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  31.51 
 
 
613 aa  309  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 
632 aa  308  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  31.04 
 
 
716 aa  306  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 
627 aa  306  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  30.64 
 
 
679 aa  306  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 
683 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  32.56 
 
 
626 aa  303  9e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  30.31 
 
 
650 aa  300  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  31.28 
 
 
644 aa  297  4e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  30.2 
 
 
652 aa  296  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  31.22 
 
 
602 aa  296  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 
628 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  32.29 
 
 
619 aa  294  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  30.31 
 
 
611 aa  293  5e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  31.08 
 
 
574 aa  294  5e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  32.04 
 
 
724 aa  293  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  31.57 
 
 
612 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  31.57 
 
 
612 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  29.94 
 
 
629 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  32.22 
 
 
586 aa  291  2e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  31.13 
 
 
689 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  29.88 
 
 
640 aa  291  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  29.54 
 
 
655 aa  291  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  30.56 
 
 
638 aa  291  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  30.79 
 
 
686 aa  290  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  29.79 
 
 
629 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 
691 aa  289  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 
662 aa  289  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  29.65 
 
 
629 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  29.65 
 
 
629 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  30.4 
 
 
678 aa  288  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 
618 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 
618 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  32.1 
 
 
610 aa  287  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 
631 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.03 
 
 
641 aa  286  8e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 
664 aa  286  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  33.02 
 
 
643 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  30.99 
 
 
648 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  31.39 
 
 
646 aa  282  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  31.21 
 
 
617 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  30.19 
 
 
667 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 
662 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  28.73 
 
 
628 aa  282  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 
603 aa  281  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>