286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2529 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 296 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  60.36 
 
 		 338 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  48.34 
 
 		 291 aa  278  7e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  48.91 
 
 		 291 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  47.97 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  47.73 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  43.88 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  42.75 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  43.8 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  45.76 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  43.49 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  41.79 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  43.28 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  38.32 
 
 		 291 aa  217  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  42.28 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  42.28 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  43.12 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  43.49 
 
 		 292 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  43.66 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  41.33 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  41.54 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  40.22 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  42.91 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  40.64 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  39.58 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  40.29 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  40.89 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  39.58 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  43.96 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  39.54 
 
 		 292 aa  202  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  41.76 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  41.09 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  39.86 
 
 		 295 aa  198  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  38.97 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  39.29 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  37.68 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  37.27 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  34.04 
 
 		 291 aa  182  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  32.35 
 
 		 293 aa  179  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  35.34 
 
 		 297 aa  175  7e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 		 399 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  32.15 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  33.58 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.5 
 
 		 257 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  33.45 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  33.61 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  33.1 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  32.69 
 
 		 388 aa  158  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  33.95 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 		 386 aa  156  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  29.79 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  32.11 
 
 		 373 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  31.44 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.68 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  30.96 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 		 402 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  31.28 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  25.87 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 409 aa  99  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3838  radical SAM domain-containing protein  41.32 
 
 		 156 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  30.25 
 
 		 501 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 490 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20660  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  28.08 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  27.5 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2062  putative methyltransferase, or Fe-S oxidoreductase  28.86 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6809  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0385  hypothetical protein  28.86 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1147  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  30.35 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125383  normal  0.546782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0692  radical SAM family protein  30.35 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346694  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1171  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397655  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4283  radical SAM family protein  30.35 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  23.11 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3408  radical SAM family protein  28.14 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2133  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  29 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0273985  normal  0.585786 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1053  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.14 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4901  radical SAM family protein  27.86 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1050  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0795903  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2201  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.36 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1179  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27 
 
 		 474 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.846685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.42 
 
 		 478 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  28.65 
 
 		 485 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  29.8 
 
 		 474 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  26.28 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.48 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.48 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3390  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.74 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>