250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2499 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 347 aa  709    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  60 
 
 		 345 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.17 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  48.7 
 
 		 344 aa  348  8e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.67 
 
 		 343 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.4 
 
 		 345 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.99 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.15 
 
 		 343 aa  291  9e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.64 
 
 		 343 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.03 
 
 		 348 aa  288  8e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  40.87 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.97 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 		 338 aa  271  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  40 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  39.41 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  38.15 
 
 		 344 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  38.12 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 		 338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 		 338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  39.64 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  39.35 
 
 		 339 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.57 
 
 		 343 aa  258  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.17 
 
 		 343 aa  258  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.55 
 
 		 347 aa  258  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.31 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.24 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.54 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.04 
 
 		 345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.98 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.92 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.22 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.41 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.76 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.76 
 
 		 343 aa  229  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.62 
 
 		 337 aa  222  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 		 344 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.65 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  35.73 
 
 		 352 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  35.78 
 
 		 343 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0620  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.09 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  34.29 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.73 
 
 		 340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  36.2 
 
 		 340 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.47 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.95 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  36.2 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  33.14 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.04 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.31 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 342 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  35.55 
 
 		 358 aa  205  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.21 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.05 
 
 		 352 aa  205  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  33.8 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  33.8 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  35.07 
 
 		 370 aa  202  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  33.33 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.09 
 
 		 373 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.57 
 
 		 355 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 339 aa  199  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.95 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  34.36 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.01 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.95 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.27 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.32 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.32 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.01 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.1 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  34.02 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.64 
 
 		 340 aa  196  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0007  heat-inducible transcription repressor  31.78 
 
 		 362 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  32.11 
 
 		 360 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  34.2 
 
 		 340 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  34.2 
 
 		 340 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  34.2 
 
 		 340 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  30.77 
 
 		 354 aa  195  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0011  heat-inducible transcription repressor  32.36 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185452 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0398  heat-inducible transcription repressor  32.27 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  32.18 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  34.64 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  32.25 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  33.62 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  34.38 
 
 		 341 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 		 350 aa  193  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  33.91 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  33.91 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>