More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2497 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  100 
 
 		 192 aa  388  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  52.66 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  52.5 
 
 		 194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  48.09 
 
 		 213 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  51.72 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  55.4 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  48.04 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  48.04 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  48.04 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  48.04 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  48.04 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  48.04 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  48.04 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  48.04 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  48.03 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  47.49 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  47.83 
 
 		 225 aa  143  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  52.08 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  45.64 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  51.39 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  51.03 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  43.04 
 
 		 226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  37.77 
 
 		 190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  41.45 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  46.21 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  45.7 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  40.11 
 
 		 178 aa  123  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45.11 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  46.67 
 
 		 172 aa  121  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  46.05 
 
 		 197 aa  120  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  41.79 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  41.67 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  40.61 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  38.85 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  38.57 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  42.11 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  40.88 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  39.53 
 
 		 210 aa  117  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  46 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  41.54 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  43.45 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  39.61 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  37.59 
 
 		 181 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  38.79 
 
 		 242 aa  114  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  42.65 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  41.38 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  36.16 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  43.61 
 
 		 202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  43.06 
 
 		 282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  35.63 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  36.07 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  38.78 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  43.07 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  39.25 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  39.25 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  36.21 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  39.15 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  35.29 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  34.98 
 
 		 239 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  35.87 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  38.78 
 
 		 207 aa  107  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  34.97 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  34.69 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  43.94 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2639  heat shock protein GrpE  38.16 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  33.67 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  34.34 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  38.78 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  39.87 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  48.84 
 
 		 208 aa  104  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  45.38 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  32.98 
 
 		 239 aa  104  9e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  36.91 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  34.59 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  34.3 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  40 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  36.94 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  36.84 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  41.1 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  34.07 
 
 		 195 aa  101  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  39.86 
 
 		 224 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  40.65 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  39.23 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  32.98 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  39.26 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  33.51 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  37.66 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  40.62 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  35.11 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2468  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 		 215 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  38.56 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  35.8 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  37.84 
 
 		 246 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  33.89 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  34.81 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2874  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 		 215 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.78 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  36.36 
 
 		 174 aa  99  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>