21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2489 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2489  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  333  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  34.94 
 
 
458 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2900  protein of unknown function DUF107  41.29 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0230935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  34.59 
 
 
436 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0857  hypothetical protein  37.72 
 
 
163 aa  93.2  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  40.24 
 
 
424 aa  81.3  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  38.73 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1632  hypothetical protein  34.59 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1666  hypothetical protein  34.59 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  30.05 
 
 
828 aa  78.6  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  32.61 
 
 
423 aa  75.1  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0392  protein of unknown function DUF107  32.89 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0391  protein of unknown function DUF107  32.89 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  31.25 
 
 
447 aa  66.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  28.31 
 
 
407 aa  63.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0326  protein of unknown function DUF107  27.33 
 
 
206 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0124428  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1141  hypothetical protein  34.88 
 
 
236 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1662  hypothetical protein  35.71 
 
 
493 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.174432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0020  hypothetical protein  29.34 
 
 
488 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0019  hypothetical protein  45.9 
 
 
158 aa  54.3  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000207386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3229  hypothetical protein  23.08 
 
 
154 aa  41.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.255062  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>