More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2484 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2484  PhoH family protein  100 
 
 
320 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3070  PhoH family protein  69.84 
 
 
324 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000842405 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2048  PhoH family protein  61.71 
 
 
323 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0134  PhoH family protein  63.17 
 
 
319 aa  416  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0593  PhoH-like protein  60.31 
 
 
333 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.318782  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  57.74 
 
 
328 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4280  PhoH family protein  56.05 
 
 
323 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  55.96 
 
 
333 aa  364  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  58.09 
 
 
320 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1198  PhoH family protein  54.55 
 
 
348 aa  363  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331138  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  56.33 
 
 
322 aa  359  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1566  PhoH-like protein  56.77 
 
 
322 aa  358  9e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.359583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1024  PhoH family protein  56.86 
 
 
320 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1272  PhoH family protein  55.31 
 
 
325 aa  349  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12600  PhoH family protein  53.67 
 
 
320 aa  349  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2611  PhoH family protein  55.3 
 
 
351 aa  349  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1985  PhoH family protein  55.21 
 
 
323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.460583  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0735  PhoH family protein  53.55 
 
 
335 aa  340  2e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.855144  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0329  PhoH family protein  56.04 
 
 
316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4204  PhoH family protein  52.37 
 
 
319 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4042  PhoH family protein  52.37 
 
 
319 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4052  PhoH family protein  52.37 
 
 
319 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4529  PhoH family protein  52.37 
 
 
319 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4327  PhoH family protein  52.37 
 
 
319 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24127e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4385  PhoH family protein  52.68 
 
 
319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4438  PhoH family protein  52.68 
 
 
319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000388335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0814  PhoH family protein  52.37 
 
 
319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.429473  decreased coverage  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  52.58 
 
 
339 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4422  PhoH family protein  54.46 
 
 
319 aa  335  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.273758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4156  PhoH family protein  54.79 
 
 
319 aa  335  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0844  phosphate starvation-inducible protein PhoH ATPase  55.27 
 
 
381 aa  333  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3031  PhoH family protein  51.91 
 
 
319 aa  333  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  50.47 
 
 
326 aa  329  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4841  PhoH family protein  55.48 
 
 
332 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  51.8 
 
 
354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  51.8 
 
 
340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  52.13 
 
 
340 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4787  PhoH family protein  55.15 
 
 
332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4663  PhoH family protein  55.15 
 
 
332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337379  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1663  PhoH family protein  52.61 
 
 
315 aa  325  5e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  50.92 
 
 
323 aa  325  5e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1629  PhoH family protein  52.61 
 
 
315 aa  325  5e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4095  PhoH-like protein  52.61 
 
 
337 aa  325  7e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  51.8 
 
 
359 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0707  PhoH family protein  52.58 
 
 
369 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0738  PhoH-like protein  53.8 
 
 
338 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1156  PhoH family protein  51.43 
 
 
340 aa  324  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  51.8 
 
 
359 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  50.32 
 
 
329 aa  323  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  50.81 
 
 
323 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0633  PhoH family protein  54.49 
 
 
332 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  52.38 
 
 
348 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3247  PhoH family protein  50.47 
 
 
348 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4346  PhoH-like protein  54.82 
 
 
340 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0509  PhoH family protein  52.3 
 
 
345 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  51.8 
 
 
335 aa  322  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  51.48 
 
 
335 aa  322  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  53 
 
 
316 aa  322  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1267  PhoH-like protein  50.16 
 
 
345 aa  322  5e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  51.48 
 
 
356 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4805  PhoH-like protein  54.49 
 
 
340 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2112  PhoH family protein  50.81 
 
 
354 aa  321  9.000000000000001e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4627  PhoH family protein  50.93 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  51.49 
 
 
316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  51.96 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  50.48 
 
 
322 aa  320  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1511  PhoH-like protein  55.3 
 
 
303 aa  319  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.489678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13580  phosphate starvation-inducible protein PhoH, predicted ATPase  53.87 
 
 
349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.340051 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0480  phosphate starvation-induced protein  52.67 
 
 
353 aa  319  5e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  51.13 
 
 
331 aa  318  7e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  51.79 
 
 
325 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4951  PhoH-like protein  53.82 
 
 
334 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1401  PhoH family protein  50.64 
 
 
322 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.100499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1285  PhoH family protein  50.64 
 
 
322 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000129158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  51.34 
 
 
359 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1120  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  48.74 
 
 
319 aa  318  1e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1458  PhoH family protein  51.16 
 
 
341 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1507  PhoH family protein  50.16 
 
 
345 aa  317  2e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048361  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0866  PhoH family protein  51.89 
 
 
339 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0777  phosphate starvation-inducible protein PhoH, ATPase  49.17 
 
 
330 aa  317  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211004  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0255  PhoH family protein  50.81 
 
 
328 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2303  PhoH family protein  49.19 
 
 
361 aa  316  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76142  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09060  PhoH-like protein  53.64 
 
 
336 aa  316  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  51.43 
 
 
354 aa  316  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3573  phoH family protein  49.69 
 
 
368 aa  315  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1653  phoH family protein  50.91 
 
 
332 aa  315  6e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0749  PhoH family protein  50.32 
 
 
327 aa  315  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3832  PhoH family protein  54.49 
 
 
351 aa  315  7e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0597  PhoH-like protein  50.32 
 
 
340 aa  315  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1138  PhoH family protein  51.63 
 
 
315 aa  315  9e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3239  putative phoH-like protein  49.23 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1415  PhoH family protein  52.32 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4666  PhoH family protein  51.8 
 
 
316 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2696  PhoH-like protein  50.47 
 
 
346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  49.55 
 
 
348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  49.55 
 
 
348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  49.55 
 
 
348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1658  PhoH family protein  51.13 
 
 
376 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  51.22 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0238  PhoH-like protein  50.48 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>