More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2482 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  100 
 
 		 153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  54.9 
 
 		 154 aa  179  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  53.12 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  49.33 
 
 		 301 aa  143  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  44.03 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  45.51 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  42.59 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  49.33 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  43.21 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  44.59 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  45.06 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  42.26 
 
 		 168 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  42.26 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  42.59 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  41.98 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  40.12 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  41.98 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  41.98 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  41.98 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  41.98 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  41.98 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  41.98 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  41.98 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  40.49 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  48.08 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  43.4 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  42.48 
 
 		 142 aa  117  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  46.62 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  43.75 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  43.75 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  40.97 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  44 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  45.93 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  44.52 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  44.44 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  49.17 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  38.93 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  41.43 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  40.13 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  36.84 
 
 		 195 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  44.09 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  48.67 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  41.61 
 
 		 153 aa  99.4  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  40.54 
 
 		 171 aa  97.1  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  40.29 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  39.19 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  38.85 
 
 		 180 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  39.44 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  39.47 
 
 		 178 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  39.19 
 
 		 171 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  38.82 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  41.88 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  40.48 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  39.73 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  40.58 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  39.04 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  39.04 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  35.76 
 
 		 190 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  42.74 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  43.12 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  34.09 
 
 		 160 aa  91.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  36.18 
 
 		 195 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  31.82 
 
 		 172 aa  90.9  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  43.97 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  38.89 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  35 
 
 		 160 aa  90.5  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  40.71 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27401  metal-dependent hydrolase  38.69 
 
 		 187 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  46.73 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0477  putative metalloprotease  43.48 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  44.25 
 
 		 411 aa  88.6  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  39.01 
 
 		 180 aa  88.2  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  47.62 
 
 		 193 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  38.32 
 
 		 189 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  41.23 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  41.94 
 
 		 161 aa  87.8  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  41.98 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1057  hypothetical protein  44.83 
 
 		 205 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.593132  normal  0.761519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  41.23 
 
 		 176 aa  87.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1814  hypothetical protein  45.45 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.28628  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0671  protein of unknown function UPF0054  41.23 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138509  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  43.9 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  40 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  40 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  43.48 
 
 		 183 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  39.53 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0729  conserved hypothetical protein (UPF0054 domain protein)  41.38 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00013142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  34.67 
 
 		 201 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  35.88 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  40.62 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  35.81 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0743  putative metalloprotease  43.22 
 
 		 138 aa  84.3  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  37.86 
 
 		 167 aa  84  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  37.69 
 
 		 154 aa  84  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0116  putative metalloprotease  41.18 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  42.98 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  33.77 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0128  putative metalloprotease  40.87 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.743032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>