42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2471 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2471  signal-transduction protein  100 
 
 
211 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3046  putative signal transduction protein with CBS domains  73.11 
 
 
212 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.174449  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0486  signal-transduction protein  63.85 
 
 
213 aa  287  9e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1732  CBS domain containing protein  61.43 
 
 
209 aa  268  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0605  signal-transduction protein  58.57 
 
 
211 aa  257  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2418  CBS domain containing protein  56.94 
 
 
209 aa  255  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1349  signal-transduction protein  57.82 
 
 
213 aa  254  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000217983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4253  Helix-turn-helix type 11 domain protein  57.42 
 
 
215 aa  247  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3023  CBS domain-containing protein  57.69 
 
 
211 aa  247  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4035  CBS domain-containing protein  57.21 
 
 
210 aa  245  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000408122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4197  CBS domain-containing protein  57.69 
 
 
210 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4521  CBS domain-containing protein  57.69 
 
 
210 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0249213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4148  signal-transduction protein  57.69 
 
 
211 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.116745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4377  CBS domain-containing protein  57.21 
 
 
210 aa  244  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000965653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4430  CBS domain protein  57.21 
 
 
210 aa  244  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4045  CBS domain-containing protein  57.21 
 
 
210 aa  244  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4414  CBS domain protein  57.69 
 
 
210 aa  244  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000209599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0822  CBS domain protein  57.69 
 
 
210 aa  244  9e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  decreased coverage  1.04097e-22 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1130  CBS domain-containing protein  55.61 
 
 
207 aa  243  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4319  CBS domain protein  56.73 
 
 
210 aa  242  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88504e-59 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1032  CBS domain containing protein  55.78 
 
 
197 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1514  CBS domain-containing protein  50.48 
 
 
219 aa  232  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2269  CBS domain-containing protein  51.43 
 
 
210 aa  221  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1984  CBS domain-containing protein  51.43 
 
 
210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1209  CBS domain containing protein  49.28 
 
 
211 aa  215  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0176414  normal  0.169489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12710  putative signal-transduction protein with CBS domains  48.31 
 
 
210 aa  204  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1656  CBS domain-containing protein  51.98 
 
 
179 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1622  CBS domain-containing protein  51.98 
 
 
179 aa  196  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1607  putative signal transduction protein with CBS domains  48.08 
 
 
238 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.913702  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2384  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.2 
 
 
212 aa  162  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000353495  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1672  CBS domain-containing protein  43.11 
 
 
170 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1329  CBS domain-containing protein  39.42 
 
 
209 aa  145  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  32.26 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
147 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  28.8 
 
 
487 aa  45.4  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  30.09 
 
 
263 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1653  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  41.51 
 
 
333 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  30.97 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  30.51 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  25.41 
 
 
141 aa  42.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  29.41 
 
 
503 aa  42  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  26.61 
 
 
332 aa  41.6  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>