More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2449 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  100 
 
 
217 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.29 
 
 
209 aa  205  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  40.87 
 
 
209 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  34.45 
 
 
210 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  34.45 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.43 
 
 
219 aa  132  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  34.12 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  33.65 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  35.24 
 
 
222 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  33.96 
 
 
225 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.96 
 
 
225 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.85 
 
 
212 aa  121  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.49 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  31.13 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  34.12 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  30.81 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  30.81 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  31.31 
 
 
216 aa  117  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  31.13 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  35.96 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  31.31 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  34.96 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  30.33 
 
 
216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  30.33 
 
 
216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  30.66 
 
 
216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  30.33 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.38 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.1 
 
 
217 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  29.72 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  32.52 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
216 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.3 
 
 
227 aa  108  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  33.96 
 
 
213 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  29.26 
 
 
235 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
223 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.96 
 
 
213 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  30.67 
 
 
232 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
235 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  34.54 
 
 
216 aa  103  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
228 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.01 
 
 
296 aa  102  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.27 
 
 
212 aa  102  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  32.54 
 
 
214 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  31.43 
 
 
216 aa  101  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  34.2 
 
 
213 aa  101  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  29.79 
 
 
252 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 
234 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.1 
 
 
206 aa  100  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  34.2 
 
 
213 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 
232 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 
232 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
233 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 
232 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
252 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
252 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
252 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
252 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  35 
 
 
214 aa  98.6  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
252 aa  98.2  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
252 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  33.16 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
252 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
252 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
252 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  28.37 
 
 
211 aa  98.2  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
252 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  32.86 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  29.36 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  33.98 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  30.45 
 
 
263 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.58 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
234 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 
226 aa  95.1  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 
226 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  28.1 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  35.94 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  28.1 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.91 
 
 
207 aa  94  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.8 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 
224 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 
225 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  33.84 
 
 
217 aa  94  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  33.68 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
226 aa  92.8  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  28.84 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.66 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.28 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  28.84 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  32.28 
 
 
233 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 
225 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  29.65 
 
 
217 aa  91.7  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  28.9 
 
 
272 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  29.58 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  26.05 
 
 
272 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 
272 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>