More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2441 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  100 
 
 
163 aa  316  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  60.13 
 
 
163 aa  201  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  62.25 
 
 
167 aa  191  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  60.42 
 
 
162 aa  179  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  50.65 
 
 
158 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  47.5 
 
 
183 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  52.34 
 
 
158 aa  144  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  51.56 
 
 
158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  52.34 
 
 
158 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  51.8 
 
 
147 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  45.1 
 
 
159 aa  142  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  55.92 
 
 
159 aa  138  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  49.31 
 
 
160 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  57.04 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  51.22 
 
 
164 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  48.12 
 
 
170 aa  131  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  50.75 
 
 
148 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  42 
 
 
168 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  45.16 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  51.85 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  47.79 
 
 
518 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.57 
 
 
164 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  40.85 
 
 
165 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  47.14 
 
 
168 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  50.34 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  40.14 
 
 
192 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  44.06 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  44.06 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  50 
 
 
166 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.05 
 
 
174 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  43.97 
 
 
164 aa  123  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  43.57 
 
 
165 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  42.11 
 
 
164 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  43.62 
 
 
165 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  43.62 
 
 
165 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  42.11 
 
 
164 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  43.8 
 
 
161 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  42.86 
 
 
161 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  45.19 
 
 
141 aa  122  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  45.32 
 
 
139 aa  121  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  39.72 
 
 
164 aa  120  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  44.59 
 
 
173 aa  120  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  42.25 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  40.27 
 
 
170 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  45 
 
 
165 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  40 
 
 
163 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.11 
 
 
164 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  40.88 
 
 
145 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  44.85 
 
 
136 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  39.44 
 
 
163 aa  117  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  41.18 
 
 
163 aa  117  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  41.38 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.46 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  45 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  39.07 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.73 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  44.3 
 
 
533 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  39.86 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  39.61 
 
 
163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  40.85 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  38.71 
 
 
194 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  38.71 
 
 
192 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  36.62 
 
 
157 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  41.55 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  39.35 
 
 
161 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  38.06 
 
 
194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  40 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  43.26 
 
 
158 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  41.79 
 
 
141 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  40.56 
 
 
159 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  40.28 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  39.44 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  39.19 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  40.14 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  37.16 
 
 
181 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  38.36 
 
 
154 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  38.13 
 
 
174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  41.55 
 
 
162 aa  111  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  35.58 
 
 
185 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  45.86 
 
 
169 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  40.26 
 
 
179 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  42.07 
 
 
154 aa  110  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  39.07 
 
 
163 aa  110  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  40.28 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  40.28 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  36.88 
 
 
178 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  40.28 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  40.28 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  36.71 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  42.07 
 
 
164 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  36.67 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  41.18 
 
 
163 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  41.18 
 
 
163 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  40.28 
 
 
164 aa  110  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.3 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  39.71 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.28 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  37.86 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  40.28 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  40.28 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>