More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2440 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  57.22 
 
 
695 aa  783    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
696 aa  1402    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  54.07 
 
 
701 aa  746    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  55.67 
 
 
681 aa  734    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  46.85 
 
 
685 aa  599  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 
660 aa  504  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.09 
 
 
677 aa  501  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
713 aa  498  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
691 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
675 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0490  CheA signal transduction histidine kinases  40.28 
 
 
692 aa  487  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
697 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
655 aa  485  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  39.49 
 
 
702 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
666 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1310  CheA signal transduction histidine kinase  40.03 
 
 
679 aa  479  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.397025  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
671 aa  481  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 
666 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
673 aa  471  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 
671 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
673 aa  469  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
729 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
674 aa  462  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  36.55 
 
 
769 aa  434  1e-120  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  34.97 
 
 
670 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  35.46 
 
 
667 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  35.6 
 
 
667 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  35.46 
 
 
667 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
653 aa  425  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
656 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  34.34 
 
 
672 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  34.31 
 
 
667 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  34.41 
 
 
670 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  33.68 
 
 
801 aa  415  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
770 aa  403  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  34.21 
 
 
660 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1856  CheA signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
658 aa  395  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 
919 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1414  CheA signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
664 aa  395  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0059  CheA signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
675 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.850831  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  49.61 
 
 
610 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  35.72 
 
 
719 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0766  CheA signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
802 aa  386  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  34.97 
 
 
692 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
670 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
919 aa  389  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  45.18 
 
 
769 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  48.58 
 
 
603 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  48.84 
 
 
604 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
688 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
920 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2888  CheA signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
671 aa  383  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  45.15 
 
 
770 aa  383  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  44.87 
 
 
770 aa  385  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  48.34 
 
 
558 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  44.71 
 
 
769 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
690 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 
607 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
650 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  44.13 
 
 
774 aa  382  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
686 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  48.84 
 
 
606 aa  382  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
671 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  47.69 
 
 
601 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 
598 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
702 aa  376  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
649 aa  378  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  46.02 
 
 
785 aa  379  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1771  CheA signal transduction histidine kinases  33.43 
 
 
727 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  47.59 
 
 
747 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  48.01 
 
 
748 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  48.01 
 
 
758 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  47.59 
 
 
739 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
688 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 
957 aa  374  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  47.59 
 
 
743 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  44.61 
 
 
783 aa  374  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  49.48 
 
 
748 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  49.48 
 
 
753 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2828  CheA signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
685 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2920  CheA signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
685 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.038084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  47.64 
 
 
754 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  47.34 
 
 
747 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
724 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
724 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 
691 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
694 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  46.35 
 
 
803 aa  369  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0612  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
652 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
686 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3264  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
679 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.671676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
695 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  47.8 
 
 
715 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  35.9 
 
 
701 aa  363  8e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
682 aa  363  8e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  48.2 
 
 
737 aa  362  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
679 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1336  CheA signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
657 aa  361  3e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280744  normal  0.428976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  34 
 
 
701 aa  361  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00032  chemotaxis protein CheA  33.43 
 
 
669 aa  360  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.814284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>