More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2365 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  73.09 
 
 
478 aa  719  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  67.85 
 
 
469 aa  637  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
474 aa  979  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  63.62 
 
 
465 aa  602  1e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  63.26 
 
 
472 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  66.01 
 
 
473 aa  592  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  61.56 
 
 
475 aa  591  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.29805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  57.75 
 
 
488 aa  553  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  55.53 
 
 
480 aa  538  1e-152  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  55.19 
 
 
477 aa  519  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  54.72 
 
 
487 aa  520  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  54.86 
 
 
474 aa  518  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
466 aa  517  1e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  55.97 
 
 
484 aa  515  1e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  54.97 
 
 
477 aa  516  1e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  54.97 
 
 
474 aa  515  1e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  55.58 
 
 
475 aa  512  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  53.78 
 
 
474 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
467 aa  507  1e-142  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  55.31 
 
 
478 aa  506  1e-142  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  55.85 
 
 
470 aa  506  1e-142  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4316  amidophosphoribosyltransferase  54.03 
 
 
514 aa  501  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  54.53 
 
 
496 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  52.79 
 
 
468 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  56.04 
 
 
466 aa  501  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4387  amidophosphoribosyltransferase  54.49 
 
 
500 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  54.45 
 
 
502 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  53.52 
 
 
493 aa  498  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  53.19 
 
 
468 aa  499  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  52.89 
 
 
505 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5114  amidophosphoribosyltransferase  53.04 
 
 
510 aa  497  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0638191  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
500 aa  495  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  56.42 
 
 
488 aa  498  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  53.93 
 
 
494 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3735  amidophosphoribosyltransferase  53.21 
 
 
558 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  55.8 
 
 
466 aa  497  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  52.92 
 
 
465 aa  495  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  52.72 
 
 
473 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  56.07 
 
 
466 aa  498  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3474  amidophosphoribosyltransferase  53.21 
 
 
563 aa  495  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  53.93 
 
 
494 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  53.04 
 
 
480 aa  495  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  54.08 
 
 
470 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1634  amidophosphoribosyltransferase  52.72 
 
 
511 aa  494  1e-138  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
473 aa  494  1e-138  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  53.41 
 
 
475 aa  492  1e-138  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34090  amidophosphoribosyltransferase  52.22 
 
 
515 aa  493  1e-138  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.163094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2352  amidophosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
513 aa  489  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.10246  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  52.84 
 
 
472 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  53.06 
 
 
472 aa  490  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  53.75 
 
 
534 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  52.62 
 
 
472 aa  491  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10823  amidophosphoribosyltransferase  53.26 
 
 
527 aa  488  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  54.24 
 
 
471 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
512 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37880  amidophosphoribosyltransferase  53.53 
 
 
512 aa  486  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.458178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4541  amidophosphoribosyltransferase  52.52 
 
 
511 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4924  amidophosphoribosyltransferase  52.52 
 
 
511 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4628  amidophosphoribosyltransferase  52.52 
 
 
511 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3089  amidophosphoribosyltransferase  52.64 
 
 
515 aa  488  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2908  amidophosphoribosyltransferase  52.43 
 
 
515 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60952  normal  0.814875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  53.49 
 
 
506 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
497 aa  483  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
503 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  53.35 
 
 
471 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  52.32 
 
 
499 aa  479  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0948  amidophosphoribosyltransferase  51.06 
 
 
525 aa  480  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  53.35 
 
 
471 aa  481  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  53.35 
 
 
471 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  53.35 
 
 
471 aa  481  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  53.35 
 
 
471 aa  480  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  53.35 
 
 
471 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08960  amidophosphoribosyltransferase  53.38 
 
 
496 aa  481  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
471 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  50.74 
 
 
493 aa  478  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  53.35 
 
 
471 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  53.35 
 
 
471 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6859  amidophosphoribosyltransferase  52.36 
 
 
525 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  53.12 
 
 
471 aa  477  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
485 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0163  amidophosphoribosyltransferase  53.56 
 
 
526 aa  478  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124827  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
461 aa  477  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3516  amidophosphoribosyltransferase  52.37 
 
 
517 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  52.14 
 
 
492 aa  476  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
485 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0154  amidophosphoribosyltransferase  53.32 
 
 
526 aa  478  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.66132  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  51.31 
 
 
482 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  52.23 
 
 
462 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3576  amidophosphoribosyltransferase  51.15 
 
 
517 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.538903  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06050  amidophosphoribosyltransferase  52.74 
 
 
518 aa  473  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.203247  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  51.44 
 
 
488 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  54.06 
 
 
485 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4041  amidophosphoribosyltransferase  51.84 
 
 
514 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181918  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 
476 aa  471  1e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  51.45 
 
 
478 aa  470  1e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3044  amidophosphoribosyltransferase  50.64 
 
 
478 aa  469  1e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0063  amidophosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
472 aa  469  1e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01750  amidophosphoribosyltransferase  52.29 
 
 
482 aa  470  1e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.674101  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  49.23 
 
 
478 aa  471  1e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
487 aa  469  1e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>