More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2361 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
422 aa  855    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  64.29 
 
 
425 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.73 
 
 
423 aa  508  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.24 
 
 
425 aa  504  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.89 
 
 
419 aa  485  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3845  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.5 
 
 
423 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000183828  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.5 
 
 
591 aa  483  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.34 
 
 
425 aa  478  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2043  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.76 
 
 
421 aa  479  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.453314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.55 
 
 
432 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.94 
 
 
419 aa  478  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.08 
 
 
424 aa  477  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3457  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.24 
 
 
423 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.021302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3523  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.53 
 
 
423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0437232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.79 
 
 
423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.72 
 
 
424 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.07 
 
 
419 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.61 
 
 
423 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2904  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.14 
 
 
423 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000288348  normal  0.785686 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.52 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.44 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.76 
 
 
429 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.46 
 
 
428 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  55.14 
 
 
429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.97 
 
 
430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.23 
 
 
428 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.91 
 
 
429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.84 
 
 
423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  53.76 
 
 
430 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.29 
 
 
429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.14 
 
 
429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.35 
 
 
427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  55.14 
 
 
429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.67 
 
 
429 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.8 
 
 
429 aa  451  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.33 
 
 
431 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.37 
 
 
423 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.08 
 
 
423 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.61 
 
 
423 aa  450  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.61 
 
 
423 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.66 
 
 
423 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.84 
 
 
423 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.86 
 
 
423 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.08 
 
 
423 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.8 
 
 
429 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  53.86 
 
 
423 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.14 
 
 
429 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.44 
 
 
423 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.99 
 
 
427 aa  448  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.46 
 
 
430 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.33 
 
 
430 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.14 
 
 
429 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.24 
 
 
456 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.37 
 
 
423 aa  448  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.33 
 
 
431 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.52 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.9 
 
 
423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.86 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  56.4 
 
 
426 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.82 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.29 
 
 
428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.21 
 
 
430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1480  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.05 
 
 
419 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.76 
 
 
429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.23 
 
 
429 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  54.12 
 
 
428 aa  442  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.47 
 
 
429 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0997  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.05 
 
 
430 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.21 
 
 
429 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.76 
 
 
429 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  54.35 
 
 
428 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.52 
 
 
429 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.88 
 
 
428 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.97 
 
 
429 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.97 
 
 
429 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.41 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  55.69 
 
 
433 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.05 
 
 
430 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.99 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.93 
 
 
428 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.66 
 
 
423 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.83 
 
 
425 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.74 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.97 
 
 
429 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.94 
 
 
428 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.93 
 
 
428 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.05 
 
 
426 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.88 
 
 
427 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0414  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.94 
 
 
427 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1777  phosphoribosylamine/glycine ligase  52.94 
 
 
428 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.7 
 
 
428 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.69 
 
 
428 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.68 
 
 
430 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  52.26 
 
 
422 aa  431  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0422  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.71 
 
 
427 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.51 
 
 
432 aa  432  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  51.41 
 
 
430 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  53.63 
 
 
430 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.93 
 
 
430 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.86 
 
 
430 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>