More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2354 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
371 aa  758    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  50.85 
 
 
357 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  46.86 
 
 
355 aa  351  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  40.46 
 
 
351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  38.87 
 
 
358 aa  266  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  37.95 
 
 
360 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  38.98 
 
 
358 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  39.13 
 
 
363 aa  248  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  38.4 
 
 
370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  41.69 
 
 
362 aa  239  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  39.39 
 
 
365 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  36.96 
 
 
369 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  36.72 
 
 
357 aa  230  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  39.5 
 
 
369 aa  228  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3996  histidinol-phosphate aminotransferase  39.5 
 
 
361 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.784945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  37.7 
 
 
363 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3191  histidinol-phosphate aminotransferase  38.38 
 
 
360 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253345  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  39.62 
 
 
369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  38.08 
 
 
377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1307  histidinol-phosphate aminotransferase  38.17 
 
 
387 aa  226  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  37.02 
 
 
358 aa  226  7e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 
368 aa  224  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  37.4 
 
 
370 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  37.04 
 
 
360 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
365 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1059  histidinol-phosphate aminotransferase  38.59 
 
 
406 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0743444  normal  0.133143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3421  histidinol-phosphate aminotransferase  40.34 
 
 
358 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  35.91 
 
 
358 aa  218  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  37.02 
 
 
358 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2393  histidinol-phosphate aminotransferase  38.04 
 
 
375 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  0.464709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3195  histidinol-phosphate aminotransferase  39.83 
 
 
358 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.505602  normal  0.19323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10880  histidinol-phosphate aminotransferase  39.5 
 
 
374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2908  histidinol-phosphate aminotransferase  37.11 
 
 
356 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1917  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
453 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0201149  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22550  histidinol phosphate aminotransferase  39.25 
 
 
380 aa  212  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 
365 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2896  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
366 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00341068  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  37.02 
 
 
386 aa  209  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1613  histidinol-phosphate aminotransferase  37.4 
 
 
379 aa  210  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  35.85 
 
 
364 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3026  histidinol-phosphate aminotransferase  37.85 
 
 
397 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.992363  normal  0.0418598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3176  histidinol-phosphate aminotransferase  37.91 
 
 
378 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 
363 aa  206  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4690  histidinol-phosphate aminotransferase  34.83 
 
 
376 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343336  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 
369 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3044  histidinol-phosphate aminotransferase  37.4 
 
 
362 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  36.21 
 
 
351 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0230  histidinol-phosphate aminotransferase  35.39 
 
 
362 aa  202  7e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  35.36 
 
 
366 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  36.59 
 
 
371 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  33.7 
 
 
373 aa  201  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2341  class I/II aminotransferase  36.81 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.416124  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  36.08 
 
 
359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  36.08 
 
 
359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  37.98 
 
 
365 aa  199  7e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  32.39 
 
 
355 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  37.98 
 
 
365 aa  199  9e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  32.39 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
366 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 
357 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 
357 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  36.23 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 
350 aa  196  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0374  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 
371 aa  196  7e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0686765  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1470  histidinol-phosphate aminotransferase  37.54 
 
 
372 aa  196  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0168842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0463  histidinol-phosphate aminotransferase  34.72 
 
 
371 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.070497  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  32.59 
 
 
371 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  36.69 
 
 
372 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000115352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 
363 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  34.84 
 
 
365 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  35.19 
 
 
367 aa  193  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 
370 aa  193  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
355 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  34.73 
 
 
348 aa  193  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  33.9 
 
 
356 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1456  histidinol-phosphate aminotransferase  34.42 
 
 
371 aa  192  9e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  33.52 
 
 
350 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2242  histidinol-phosphate aminotransferase  34.65 
 
 
380 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1151  histidinol-phosphate aminotransferase  37.33 
 
 
367 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  36.5 
 
 
363 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  34.63 
 
 
374 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  34.09 
 
 
358 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  34.37 
 
 
356 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  33.99 
 
 
365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  32.42 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  32.42 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  33.97 
 
 
365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  34.93 
 
 
350 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2316  histidinol-phosphate aminotransferase  35.73 
 
 
374 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7445  histidinol-phosphate aminotransferase  36.97 
 
 
370 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  35.91 
 
 
386 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  32.69 
 
 
356 aa  189  7e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11616  histidinol-phosphate aminotransferase  34.99 
 
 
380 aa  189  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  35.42 
 
 
369 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07350  histidinol-phosphate aminotransferase  36.89 
 
 
373 aa  188  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  34.77 
 
 
352 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  30.96 
 
 
351 aa  188  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  36.51 
 
 
379 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0531  histidinol-phosphate aminotransferase  34.62 
 
 
371 aa  188  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.237574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  34.54 
 
 
353 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>