More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2346 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  52.61 
 
 		 684 aa  710    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  59.91 
 
 		 677 aa  834    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  51.42 
 
 		 670 aa  677    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 670 aa  1373    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  50.45 
 
 		 665 aa  676    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.74 
 
 		 669 aa  741    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.74 
 
 		 669 aa  740    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  55.59 
 
 		 669 aa  739    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  54.5 
 
 		 670 aa  732    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  53.92 
 
 		 663 aa  730    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.89 
 
 		 669 aa  743    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.89 
 
 		 669 aa  744    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.89 
 
 		 669 aa  743    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  50.23 
 
 		 668 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  56.82 
 
 		 662 aa  759    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  48.6 
 
 		 678 aa  641    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  51.44 
 
 		 688 aa  668    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  48.59 
 
 		 711 aa  641    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.57 
 
 		 676 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  50.45 
 
 		 675 aa  640    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  50.52 
 
 		 672 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  50.61 
 
 		 671 aa  655    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  52.64 
 
 		 671 aa  688    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  52.78 
 
 		 673 aa  731    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.29 
 
 		 669 aa  733    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.89 
 
 		 669 aa  743    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.83 
 
 		 679 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  48.74 
 
 		 707 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  56.82 
 
 		 659 aa  764    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  59.34 
 
 		 666 aa  766    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  49.69 
 
 		 674 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  51.8 
 
 		 667 aa  696    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  60.03 
 
 		 672 aa  828    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  49.69 
 
 		 674 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  51.8 
 
 		 667 aa  696    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  49.47 
 
 		 673 aa  639    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.89 
 
 		 669 aa  743    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.59 
 
 		 669 aa  741    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  50.38 
 
 		 668 aa  652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  52.88 
 
 		 663 aa  721    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  58.47 
 
 		 670 aa  793    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  51.44 
 
 		 688 aa  668    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  48.46 
 
 		 708 aa  639    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  49.18 
 
 		 673 aa  643    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  52.43 
 
 		 661 aa  693    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  49.1 
 
 		 681 aa  651    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  50.6 
 
 		 683 aa  637    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  49.63 
 
 		 694 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  58.2 
 
 		 672 aa  802    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.74 
 
 		 669 aa  742    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.56 
 
 		 670 aa  744    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  48.38 
 
 		 697 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  50 
 
 		 685 aa  633  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  49.32 
 
 		 673 aa  629  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  50.22 
 
 		 726 aa  631  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.34 
 
 		 738 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  48.74 
 
 		 675 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  47.34 
 
 		 691 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  46.93 
 
 		 680 aa  627  1e-178  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  47.35 
 
 		 746 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  48.11 
 
 		 673 aa  625  1e-178  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  47.49 
 
 		 691 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  48.81 
 
 		 684 aa  628  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  47.35 
 
 		 691 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  47.64 
 
 		 691 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  47.91 
 
 		 680 aa  623  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  47.2 
 
 		 691 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  47.2 
 
 		 691 aa  623  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  47.81 
 
 		 683 aa  625  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  49.48 
 
 		 682 aa  619  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  49.48 
 
 		 718 aa  621  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  49.41 
 
 		 712 aa  621  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  47.2 
 
 		 691 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  47.96 
 
 		 670 aa  621  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  47.84 
 
 		 688 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  48.57 
 
 		 671 aa  620  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  47.03 
 
 		 708 aa  620  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 691 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 691 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 691 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0624  NAD-dependent DNA ligase  49.26 
 
 		 686 aa  615  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.182096  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 691 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 691 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 691 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  47.24 
 
 		 688 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  46.55 
 
 		 721 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 691 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  47.96 
 
 		 671 aa  618  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  47.94 
 
 		 678 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  46.36 
 
 		 662 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.54 
 
 		 680 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1515  NAD-dependent DNA ligase  47.49 
 
 		 668 aa  612  9.999999999999999e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.872196 
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  46.66 
 
 		 677 aa  608  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  47.83 
 
 		 673 aa  610  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  48.66 
 
 		 681 aa  611  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  47.77 
 
 		 704 aa  610  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  47.73 
 
 		 706 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  46.99 
 
 		 668 aa  606  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_536  DNA ligase, NAD-dependent  46.87 
 
 		 680 aa  605  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  48.07 
 
 		 690 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>