120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2310 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2310  GDSL family lipase  100 
 
 
307 aa  634    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  34.48 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1716  lipolytic protein  36.76 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000204836  normal  0.492944 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.81 
 
 
183 aa  109  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4411  lipolytic protein G-D-S-L family  28.29 
 
 
228 aa  96.3  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0772  GDSL family lipase  30.73 
 
 
201 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1252  lipolytic protein G-D-S-L family  27.23 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  32.99 
 
 
261 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2398  hypothetical protein  27.81 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0206  lipolytic protein G-D-S-L family  30.89 
 
 
173 aa  64.7  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2134  GDSL family lipase  30.15 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306238  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  25.38 
 
 
252 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  34.65 
 
 
216 aa  60.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  26.84 
 
 
204 aa  60.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  26.29 
 
 
201 aa  59.3  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0057  lipolytic protein G-D-S-L family  30.19 
 
 
212 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  33 
 
 
204 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  28.19 
 
 
214 aa  56.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  30.77 
 
 
212 aa  56.2  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4506  lipolytic protein G-D-S-L family  26.54 
 
 
230 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  26.54 
 
 
230 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2498  putative acyl-CoA thioesterase  22.08 
 
 
186 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  28.32 
 
 
207 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3193  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  23.23 
 
 
197 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.194164  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  23.74 
 
 
197 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118083  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  25.26 
 
 
213 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.43 
 
 
201 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  24.76 
 
 
188 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  26.09 
 
 
202 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  25.12 
 
 
188 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  24.46 
 
 
206 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  29.01 
 
 
202 aa  52.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  26.55 
 
 
218 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  24.73 
 
 
214 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  25.65 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  23.44 
 
 
188 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  28.57 
 
 
201 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3118  esterase  24.64 
 
 
188 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  30.77 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  23.98 
 
 
209 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3582  lipolytic protein G-D-S-L family  22.73 
 
 
241 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  26.23 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  25.63 
 
 
261 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18470  hypothetical protein  27.81 
 
 
224 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0868279  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  28.06 
 
 
195 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  25.85 
 
 
223 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  26.09 
 
 
189 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  21.36 
 
 
250 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  28.89 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0828  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.4 
 
 
500 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0189609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  30.56 
 
 
223 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2175  lipolytic protein G-D-S-L family  25.53 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.045511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  30.09 
 
 
424 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0762  lipolytic protein G-D-S-L family  23.67 
 
 
222 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4796  lipolytic protein  25.57 
 
 
239 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  25.77 
 
 
208 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  26.06 
 
 
226 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  27.89 
 
 
286 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  29.73 
 
 
269 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  23.44 
 
 
220 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1259  lipolytic protein G-D-S-L family  26.54 
 
 
725 aa  47  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.437163  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  25.76 
 
 
203 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1157  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  23.42 
 
 
196 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.987019  hitchhiker  0.000093812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  31.52 
 
 
200 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2204  acyl-CoA thioesterase, putative  31.43 
 
 
186 aa  46.2  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  25.15 
 
 
277 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1774  lipolytic protein G-D-S-L family  24.51 
 
 
229 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3443  esterase  23.67 
 
 
188 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  27.7 
 
 
275 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  25 
 
 
208 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  25 
 
 
197 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1881  lipolytic protein  26.85 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0892024  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  25 
 
 
207 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  25 
 
 
218 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  25 
 
 
197 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  25 
 
 
207 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  25 
 
 
207 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  31.31 
 
 
201 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  28.28 
 
 
188 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.71 
 
 
198 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  25.2 
 
 
199 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  24.19 
 
 
208 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  24 
 
 
204 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  24 
 
 
204 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  24 
 
 
204 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  24 
 
 
204 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  24 
 
 
204 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0598  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  25 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.79584 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  30.65 
 
 
208 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  24.27 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2490  acyl-CoA thioesterase I precursor  23.03 
 
 
201 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.860035  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  24.87 
 
 
212 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  29.03 
 
 
216 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  30.65 
 
 
208 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  30.53 
 
 
232 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.44 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  28.72 
 
 
202 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  26.14 
 
 
203 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  30.53 
 
 
210 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>