74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2294 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2294  catalase  100 
 
 
134 aa  278  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  85.71 
 
 
231 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000426374  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  72.12 
 
 
228 aa  161  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  0.00000000343768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  78 
 
 
224 aa  157  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  67.62 
 
 
227 aa  138  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  54.44 
 
 
205 aa  97.1  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  46.59 
 
 
276 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  42.28 
 
 
324 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  42.28 
 
 
326 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  45.65 
 
 
310 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  42.05 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000198818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  41.57 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  41.3 
 
 
293 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  39.77 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  39.77 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  39.77 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  39.77 
 
 
292 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  39.77 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  50 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  39.77 
 
 
291 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  45.59 
 
 
296 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  39.13 
 
 
314 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  39.56 
 
 
290 aa  63.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  39.13 
 
 
298 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  39.13 
 
 
298 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  40.45 
 
 
293 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  39.77 
 
 
303 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  47.69 
 
 
308 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  38.2 
 
 
300 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  46.15 
 
 
301 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  44.62 
 
 
304 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  44.62 
 
 
301 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  44.62 
 
 
304 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  46.27 
 
 
277 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0232  Catalase  44.29 
 
 
200 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  47.76 
 
 
190 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  37.63 
 
 
230 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  42.42 
 
 
188 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3821  manganese containing catalase  36.56 
 
 
230 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00457633  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  40.91 
 
 
188 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  33.33 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000213334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  33.33 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000889969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  33.33 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0899  cotJC protein  33.33 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.71221e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  33.33 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  33.33 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0803  spore coat-associated protein JC  33.33 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000303709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  43.28 
 
 
421 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  34.41 
 
 
231 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  34.25 
 
 
189 aa  50.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  35.14 
 
 
190 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0656  manganese containing catalase  32.14 
 
 
189 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.807783  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  33.82 
 
 
289 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  37.18 
 
 
203 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0895  cotJC protein  30.95 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000660321  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  29.82 
 
 
245 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4479  cotJC protein  30.95 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.163427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  35.48 
 
 
260 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  34.33 
 
 
302 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0716  manganese containing catalase  32.14 
 
 
189 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000621736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1392  manganese containing catalase  40 
 
 
190 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  31.94 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  31.46 
 
 
249 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  34.92 
 
 
270 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  33.82 
 
 
189 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  27.5 
 
 
286 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  31.34 
 
 
301 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  28.12 
 
 
297 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  28.12 
 
 
274 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  26.88 
 
 
308 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23050  manganese containing catalase  34.92 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  28.12 
 
 
275 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  30 
 
 
285 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3979  catalase  25 
 
 
274 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>