More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2225 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  100 
 
 
257 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  50.6 
 
 
264 aa  271  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
261 aa  265  7e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  47.41 
 
 
265 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  47.64 
 
 
264 aa  253  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  47.98 
 
 
262 aa  246  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  47.18 
 
 
264 aa  246  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  47.22 
 
 
265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  46.22 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  42.8 
 
 
264 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  40.55 
 
 
264 aa  236  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  42.4 
 
 
264 aa  236  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  46.43 
 
 
267 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  40.16 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  40.16 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  41.6 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 
265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  44.22 
 
 
263 aa  233  3e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  40.55 
 
 
264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  40.55 
 
 
264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  40.55 
 
 
264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  41.43 
 
 
270 aa  232  6e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  41.34 
 
 
264 aa  231  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  40.55 
 
 
264 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 
267 aa  231  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  42.4 
 
 
264 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  40.55 
 
 
264 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  42 
 
 
264 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 
264 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  40.94 
 
 
264 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  41.34 
 
 
264 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 
264 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 
264 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 
264 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 
264 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 
264 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 
264 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  42 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  41.34 
 
 
264 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  43.25 
 
 
264 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  45.63 
 
 
265 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  40.55 
 
 
264 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  40.8 
 
 
264 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  42.4 
 
 
264 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  45.38 
 
 
263 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 
267 aa  224  9e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
270 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  44.05 
 
 
264 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 
267 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  39.44 
 
 
264 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  42.63 
 
 
296 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  41.43 
 
 
265 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  40.24 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  41.34 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  40.94 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  39.76 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 
264 aa  218  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  42.63 
 
 
265 aa  218  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 
264 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  39.44 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  46.52 
 
 
251 aa  215  5e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  38.8 
 
 
282 aa  214  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  40.55 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 
245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  37.45 
 
 
264 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  38.65 
 
 
265 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.22 
 
 
254 aa  209  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  42.74 
 
 
254 aa  209  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  46.55 
 
 
262 aa  209  5e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  42.44 
 
 
252 aa  207  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  41.34 
 
 
264 aa  206  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.48 
 
 
256 aa  206  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  39.36 
 
 
264 aa  204  8e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.95 
 
 
251 aa  196  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 
253 aa  191  8e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  33.86 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  39.06 
 
 
242 aa  181  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0447  ABC transporter related  31.06 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  34.21 
 
 
242 aa  119  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  36.54 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  36.86 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  36.86 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.28 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  35.29 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  35.24 
 
 
328 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  35.17 
 
 
242 aa  116  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 
226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  36.44 
 
 
226 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  36.84 
 
 
357 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3187  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.03 
 
 
248 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3326  ABC transporter related  32.03 
 
 
248 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 
226 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3446  purine catabolism protein PucG  32.03 
 
 
506 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  32.57 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>