228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2222 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
276 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.67 
 
 
282 aa  285  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.18 
 
 
287 aa  272  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.68 
 
 
288 aa  261  6.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0617  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.79 
 
 
284 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000727568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1831  hypothetical protein  45.79 
 
 
285 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0748  MinD family ATPase  45.68 
 
 
292 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0462  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.82 
 
 
285 aa  254  7e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.8 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1954  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.68 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.03 
 
 
284 aa  249  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1188  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.44 
 
 
285 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1089  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.73 
 
 
278 aa  248  5e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000771528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.68 
 
 
281 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0658  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.09 
 
 
282 aa  244  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.66 
 
 
282 aa  241  9e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.57 
 
 
283 aa  239  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.24 
 
 
277 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.01 
 
 
293 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1537  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.35 
 
 
287 aa  234  9e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000218492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1585  MinD family ATPase  39.71 
 
 
282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1983  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.28 
 
 
291 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1530  hypothetical protein  42.91 
 
 
280 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000791704  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2427  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.57 
 
 
283 aa  223  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.71 
 
 
289 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
652 aa  208  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.13 
 
 
293 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2163  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.82 
 
 
283 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.61 
 
 
301 aa  198  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0340  hypothetical protein  37.6 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00338872  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0442  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 
290 aa  193  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3200  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  35.1 
 
 
311 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.752938  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0195  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.45 
 
 
288 aa  194  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.19 
 
 
351 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.490364  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0392  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.17 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.458285  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.96 
 
 
296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0012  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.99 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1528  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.55 
 
 
288 aa  149  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.539441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.04 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1445  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.21 
 
 
282 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.121455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1233  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.75 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535744  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.86 
 
 
282 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3201  iron-sulfur cluster-binding/ATPase domain-containing protein  29.82 
 
 
308 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0615  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.4 
 
 
290 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0463  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.29 
 
 
282 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0564  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.82 
 
 
286 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0341  hypothetical protein  31.03 
 
 
293 aa  132  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0105229  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1588  MinD family ATPase  32.75 
 
 
291 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0441  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.62 
 
 
285 aa  132  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.278106  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.92 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0328057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18370  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.59 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2426  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.45 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.28 
 
 
287 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 
289 aa  125  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1408  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.57 
 
 
287 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.152479  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.66 
 
 
306 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.08 
 
 
290 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.394361  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1830  hypothetical protein  28.91 
 
 
310 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.705168  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1529  MinD family protein  30.99 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00592522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.63 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100498  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0825  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.22 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.64 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000290019  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0577  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.27 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.016855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1090  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.62 
 
 
280 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000859922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0657  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.23 
 
 
286 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0145251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.48 
 
 
292 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1984  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.21 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.39 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1951  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.86 
 
 
305 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2078  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.77 
 
 
275 aa  105  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0747  MinD family ATPase  33.77 
 
 
299 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0997  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.16 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.912135  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0619  nitrite and sulphite reductase  41.94 
 
 
639 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00799056  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1509  ParaA family ATPase  27.13 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1318  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.83 
 
 
259 aa  52.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.63 
 
 
840 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.86 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00451529  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0694  NADH ubiquinone oxidoreductase 20 kDa subunit  42.42 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.244067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2330  coenzyme F420 hydrogenase  32 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.88 
 
 
263 aa  49.3  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.05575  normal  0.0499617 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08160  4Fe-4S protein  44.64 
 
 
322 aa  49.7  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.127337 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4082  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.61 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.11 
 
 
1481 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.37 
 
 
370 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0477  hydrogenase large subunit  31.33 
 
 
478 aa  48.9  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04760  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
149 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000206587  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1749  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.37 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2104  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.11 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2642  iron-sulfur cluster-binding protein  38.46 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.317648  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1777  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.21 
 
 
369 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0552  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  44 
 
 
786 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0563725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  32.35 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 
619 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1876  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.89 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2247  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.3 
 
 
427 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000011371  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0629  coenzyme F420 hydrogenase  42.55 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.871927 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0194  coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit  42.55 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0331  nitrogenase reductase related protein  25.74 
 
 
212 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.3746  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0647  coenzyme F420-reducing hydrogenase, gamma subunit  42.55 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>