More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2154 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  100 
 
 
139 aa  274  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  64.93 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  55.64 
 
 
146 aa  150  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  48.18 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  51.47 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  44.53 
 
 
167 aa  124  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  41.48 
 
 
164 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  45.32 
 
 
163 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  41.48 
 
 
168 aa  120  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  40 
 
 
164 aa  119  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  44.44 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  44.44 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  41.13 
 
 
165 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  43.06 
 
 
167 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  38.85 
 
 
168 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  43.28 
 
 
163 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  37.78 
 
 
165 aa  110  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  39.42 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  41.18 
 
 
159 aa  107  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  40.44 
 
 
183 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  36.69 
 
 
164 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  42.54 
 
 
158 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  38.97 
 
 
147 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  45.53 
 
 
164 aa  103  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  38.57 
 
 
165 aa  103  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  38.57 
 
 
165 aa  103  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  39.55 
 
 
148 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  44.54 
 
 
158 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  45.38 
 
 
158 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  38.35 
 
 
170 aa  101  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  45.69 
 
 
169 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  35.51 
 
 
159 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  36.57 
 
 
163 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  38.41 
 
 
533 aa  100  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  37.31 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  43.7 
 
 
158 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  42.86 
 
 
165 aa  98.6  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  41.61 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  38.57 
 
 
165 aa  98.6  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  40.85 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  44.88 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  41.04 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  38.41 
 
 
169 aa  97.4  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  36.57 
 
 
162 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  37.31 
 
 
192 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.46 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  34.33 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  39.86 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.97 
 
 
164 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.64 
 
 
164 aa  95.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  37.04 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  36.57 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  41.35 
 
 
518 aa  95.5  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  38.3 
 
 
189 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.75 
 
 
164 aa  94.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  37.4 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  35.82 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  38.69 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.82 
 
 
159 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  35.82 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  39.84 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  35.82 
 
 
159 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  35.82 
 
 
159 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  35.82 
 
 
159 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  36.76 
 
 
160 aa  94.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2218  chemotaxis protein CheW  41.61 
 
 
158 aa  94  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  35.46 
 
 
161 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  34.78 
 
 
163 aa  93.6  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  34.59 
 
 
141 aa  93.6  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  32.84 
 
 
164 aa  92.8  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  35.07 
 
 
161 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  32.84 
 
 
164 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  32.84 
 
 
164 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  32.84 
 
 
164 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  34.06 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  32.84 
 
 
164 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  35.51 
 
 
164 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  39.52 
 
 
515 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  33.33 
 
 
185 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  32.64 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  32.84 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  35.51 
 
 
164 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  34.33 
 
 
159 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.33 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  33.33 
 
 
185 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  43.56 
 
 
520 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.81 
 
 
164 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  34.33 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  32.84 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  32.59 
 
 
478 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  34.33 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.94 
 
 
164 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  32.84 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.84 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  32.84 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  32.84 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  32.84 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  34.33 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  34.06 
 
 
162 aa  90.9  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  34.06 
 
 
157 aa  90.9  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>