More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2145 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.31 
 
 		 1172 aa  776    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1271 aa  2617    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 1195 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 		 1896 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 1917 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 1356 aa  390  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 2099 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 1839 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 1954 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 2107 aa  383  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  33.75 
 
 		 1278 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 		 2099 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 		 1203 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 		 1038 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  34.28 
 
 		 1158 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1159 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 		 1237 aa  372  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  32.91 
 
 		 1695 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 1155 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1201 aa  365  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 		 1141 aa  364  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 1155 aa  363  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 1936 aa  363  9e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1149 aa  363  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 		 1155 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  36.15 
 
 		 1161 aa  360  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 		 1142 aa  359  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 		 1168 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  33.33 
 
 		 1200 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 1937 aa  358  5e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 		 1155 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  32.95 
 
 		 1172 aa  355  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  33.53 
 
 		 1937 aa  354  7e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 1937 aa  352  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  32.41 
 
 		 1137 aa  352  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 		 1216 aa  352  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  32.49 
 
 		 1196 aa  351  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 		 1713 aa  349  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  32.89 
 
 		 1170 aa  348  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 		 1137 aa  348  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 2037 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 		 1143 aa  345  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 		 1163 aa  345  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1161 aa  344  5.999999999999999e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  32.21 
 
 		 1374 aa  341  5.9999999999999996e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 		 1158 aa  340  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 1189 aa  339  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 858 aa  339  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 1145 aa  338  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 1680 aa  336  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 917 aa  336  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 970 aa  336  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 791 aa  335  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 2010 aa  333  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 1160 aa  333  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 1362 aa  333  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 1942 aa  330  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 1158 aa  328  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  33.44 
 
 		 1361 aa  328  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 1792 aa  327  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1037 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1022 aa  322  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 		 991 aa  318  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 687 aa  318  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 977 aa  317  7e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 		 1361 aa  316  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 975 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  35.56 
 
 		 998 aa  315  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 		 796 aa  315  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 1131 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 927 aa  310  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 		 798 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1003 aa  308  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  29.18 
 
 		 792 aa  308  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 974 aa  307  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 		 803 aa  307  9.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.31 
 
 		 916 aa  307  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 		 1767 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 		 1767 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 882 aa  305  5.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 1046 aa  303  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.62 
 
 		 933 aa  302  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  32.96 
 
 		 910 aa  301  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 		 1767 aa  301  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1162 aa  299  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 1054 aa  299  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 1267 aa  297  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 		 1363 aa  296  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 		 823 aa  295  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 		 1202 aa  295  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  30.52 
 
 		 1765 aa  294  6e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 		 1771 aa  293  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  41.48 
 
 		 661 aa  290  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 1768 aa  290  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 984 aa  288  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 		 1782 aa  287  9e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 		 1784 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1055 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 902 aa  285  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1786 aa  285  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>