More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2140 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  46.06 
 
 
828 aa  692    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  49.01 
 
 
837 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  46.29 
 
 
799 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  58.52 
 
 
821 aa  888    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  51.38 
 
 
794 aa  808    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  48.5 
 
 
792 aa  700    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  54.81 
 
 
806 aa  836    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  54.81 
 
 
805 aa  854    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  53.57 
 
 
802 aa  824    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  50.13 
 
 
752 aa  691    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  44.23 
 
 
826 aa  663    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  48.93 
 
 
804 aa  694    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  54.15 
 
 
798 aa  809    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  54.56 
 
 
805 aa  831    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  54.56 
 
 
805 aa  827    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  54.56 
 
 
805 aa  830    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  46.14 
 
 
827 aa  667    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  44.18 
 
 
844 aa  661    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  47.09 
 
 
839 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  59.09 
 
 
743 aa  862    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  49.57 
 
 
836 aa  755    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  45.26 
 
 
841 aa  646    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  46.24 
 
 
836 aa  677    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  49.02 
 
 
818 aa  748    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  49.24 
 
 
819 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  47.85 
 
 
954 aa  708    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  50.57 
 
 
790 aa  729    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  52 
 
 
753 aa  729    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  51.85 
 
 
759 aa  723    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  48.58 
 
 
823 aa  675    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  46.73 
 
 
828 aa  684    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  46.3 
 
 
797 aa  679    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  50 
 
 
849 aa  735    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  46.17 
 
 
834 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  45.8 
 
 
833 aa  670    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  45.79 
 
 
819 aa  655    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  49.13 
 
 
750 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  44.73 
 
 
868 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  47.52 
 
 
885 aa  725    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  54.56 
 
 
805 aa  831    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  47.41 
 
 
799 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  48.59 
 
 
747 aa  652    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  50.82 
 
 
801 aa  691    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  46.31 
 
 
827 aa  686    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  47.31 
 
 
857 aa  739    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  52.64 
 
 
796 aa  807    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  54.56 
 
 
805 aa  829    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  44.67 
 
 
833 aa  653    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  46.24 
 
 
836 aa  677    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3238  heavy metal translocating P-type ATPase  46.28 
 
 
831 aa  655    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141164  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  46.42 
 
 
799 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  55.62 
 
 
797 aa  878    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  46.19 
 
 
829 aa  636    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  54.81 
 
 
806 aa  830    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  52.2 
 
 
817 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  52.2 
 
 
817 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  46.2 
 
 
841 aa  682    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  46.27 
 
 
942 aa  702    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  44.16 
 
 
872 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  46.12 
 
 
841 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  57.23 
 
 
815 aa  911    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  45.99 
 
 
797 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3524  heavy metal translocating P-type ATPase  50.19 
 
 
813 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  44.3 
 
 
866 aa  689    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  48.78 
 
 
838 aa  739    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  47.56 
 
 
836 aa  731    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  47.56 
 
 
833 aa  695    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  49.34 
 
 
831 aa  669    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  47.21 
 
 
838 aa  667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  46.49 
 
 
826 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  46.84 
 
 
835 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
803 aa  1624    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  51.66 
 
 
751 aa  659    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  46.74 
 
 
800 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  47.72 
 
 
840 aa  696    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  47.02 
 
 
855 aa  681    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  54.68 
 
 
805 aa  832    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  47.43 
 
 
889 aa  745    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  47.67 
 
 
889 aa  746    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  48.42 
 
 
758 aa  648    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  43.54 
 
 
821 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  53.57 
 
 
802 aa  824    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  56.91 
 
 
799 aa  840    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  46.15 
 
 
946 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  48.12 
 
 
792 aa  692    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  45.24 
 
 
826 aa  654    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  54.56 
 
 
806 aa  833    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  44.67 
 
 
866 aa  649    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  44.71 
 
 
836 aa  675    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  48.27 
 
 
814 aa  698    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  45.62 
 
 
835 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  47.98 
 
 
813 aa  664    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  47.04 
 
 
827 aa  674    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  48.23 
 
 
786 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  54.72 
 
 
797 aa  833    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  46.48 
 
 
790 aa  669    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  48.16 
 
 
759 aa  660    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  46.17 
 
 
852 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  54.15 
 
 
798 aa  809    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  52.7 
 
 
837 aa  775    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>