33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2125 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  97.25 
 
 
472 aa  924    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  100 
 
 
472 aa  949    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1304  hypothetical protein  31.91 
 
 
371 aa  126  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3724  hypothetical protein  29.85 
 
 
460 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2826  Ig domain-containing protein  31.41 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1295  hypothetical protein  28.86 
 
 
460 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  32.37 
 
 
4630 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  29.33 
 
 
1361 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1230  hypothetical protein  29.07 
 
 
269 aa  62  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  30.53 
 
 
981 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  32.31 
 
 
1009 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  25.67 
 
 
1300 aa  57  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  30.11 
 
 
1279 aa  56.6  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  26.24 
 
 
437 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  24.86 
 
 
220 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  32.04 
 
 
1193 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  28.7 
 
 
799 aa  50.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  27.84 
 
 
316 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  27.74 
 
 
1077 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  31.62 
 
 
2638 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  28.78 
 
 
2042 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  32.39 
 
 
892 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2596  Ig domain-containing protein  28.23 
 
 
390 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000321445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  36.89 
 
 
1048 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  34.65 
 
 
1467 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  34.65 
 
 
1937 aa  47.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  32 
 
 
688 aa  46.6  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  29.27 
 
 
1965 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  26.15 
 
 
575 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  27.01 
 
 
466 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  23.23 
 
 
462 aa  44.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  30.5 
 
 
570 aa  43.1  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32 
 
 
752 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>