163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2114 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 234 aa  470  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  39.09 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  32.13 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  32.88 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  32.48 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  30.09 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  30.47 
 
 		 262 aa  98.6  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  37.91 
 
 		 322 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  36.42 
 
 		 274 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  37.7 
 
 		 307 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  28.7 
 
 		 263 aa  95.5  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  34.32 
 
 		 283 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  31.6 
 
 		 284 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  33.17 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  32.16 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  31.08 
 
 		 291 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  31.2 
 
 		 282 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  36.07 
 
 		 307 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  31.75 
 
 		 306 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  28.21 
 
 		 298 aa  90.1  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.361703 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  31.17 
 
 		 279 aa  89.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  35.23 
 
 		 279 aa  89.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  35.23 
 
 		 281 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  31.98 
 
 		 286 aa  89  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  30.95 
 
 		 291 aa  89  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  35.23 
 
 		 281 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  35.23 
 
 		 281 aa  89  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  31.44 
 
 		 279 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  31.44 
 
 		 279 aa  88.6  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  31.7 
 
 		 281 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  31.94 
 
 		 280 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  30.22 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  32.05 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  30.57 
 
 		 279 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  34.86 
 
 		 283 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  31.25 
 
 		 281 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  35.09 
 
 		 281 aa  85.1  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  27.35 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  32.72 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  31.86 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  29.74 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  31.79 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  31.88 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  28.57 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  31.11 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  22.22 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  29.36 
 
 		 298 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  30.73 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  28.64 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  32.67 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  31.84 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  37.33 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  33.73 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2058  Flp pilus assembly CpaB  34.66 
 
 		 342 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308551  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0795  Flp pilus assembly protein CpaB  30.77 
 
 		 390 aa  75.5  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  37.33 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  28.27 
 
 		 278 aa  75.1  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3420  Flp pilus assembly CpaB  37.18 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.685338 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1817  Flp pilus assembly protein CpaB  24.77 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  28.87 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  32.19 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  31.54 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  33.77 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3927  Flp pilus assembly protein CpaB  36.54 
 
 		 342 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152772  normal  0.4164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  31.18 
 
 		 260 aa  72  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  27.59 
 
 		 342 aa  71.6  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  33.6 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  29.83 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  31.61 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  29.9 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  29.83 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  32.48 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2690  Flp pilus assembly protein CpaB  26.58 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  27.34 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  29.83 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  29.41 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  29.41 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  29.41 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  29.41 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3515  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  38.1 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  27.47 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  34.18 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1757  Flp pilus assembly protein CpaB  29.78 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.336594  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  26.85 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  30 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  36.05 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  28.89 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1513  hypothetical protein  28.06 
 
 		 309 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139808 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  33.64 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  28.25 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  35.82 
 
 		 345 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  35.66 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  27.27 
 
 		 331 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  28.72 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  31.37 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  28.26 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.32 
 
 		 292 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  32 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  26.36 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>