16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2099 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2099  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  38.1 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  37.31 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  33.85 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  41.27 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  36.51 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  37.31 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0269  putative transmembrane protein  36.36 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514817  normal  0.593494 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  36.51 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  41.54 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0448  hypothetical protein  36.07 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000908926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  34.43 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  39.29 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  32.84 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  36.51 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>