More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2094 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  100 
 
 
396 aa  809    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  59.34 
 
 
399 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  59.6 
 
 
398 aa  504  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  58.08 
 
 
398 aa  501  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  58.59 
 
 
397 aa  494  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  59.85 
 
 
408 aa  497  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  57.83 
 
 
397 aa  494  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  58.33 
 
 
395 aa  488  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  56.82 
 
 
399 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  59.8 
 
 
406 aa  483  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  59.3 
 
 
406 aa  484  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  55.81 
 
 
398 aa  481  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  57.83 
 
 
405 aa  480  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  57.47 
 
 
397 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  58.65 
 
 
403 aa  476  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  58.65 
 
 
403 aa  476  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  57.79 
 
 
401 aa  468  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  57.07 
 
 
397 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  55.56 
 
 
398 aa  464  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  55.03 
 
 
399 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  55.3 
 
 
397 aa  461  1e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  58.19 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  53.67 
 
 
398 aa  456  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  55.22 
 
 
396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  53.28 
 
 
398 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  54.45 
 
 
397 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  53.03 
 
 
398 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  54.43 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  52.67 
 
 
397 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  52.67 
 
 
397 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  52.15 
 
 
397 aa  434  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  51.9 
 
 
397 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  51.9 
 
 
397 aa  431  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  53.44 
 
 
398 aa  429  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  51.9 
 
 
397 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  51.65 
 
 
397 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  51.65 
 
 
397 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  51.9 
 
 
397 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  51.9 
 
 
397 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  51.65 
 
 
397 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  50.63 
 
 
404 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  52.14 
 
 
401 aa  425  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  50.76 
 
 
404 aa  421  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  50.25 
 
 
421 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  53.4 
 
 
397 aa  423  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  50.13 
 
 
421 aa  421  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  51.02 
 
 
421 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  51.15 
 
 
417 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  52.81 
 
 
400 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  50.76 
 
 
421 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  52.81 
 
 
400 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  53.18 
 
 
396 aa  413  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  50.13 
 
 
417 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  49.12 
 
 
421 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  48.74 
 
 
420 aa  408  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  50.51 
 
 
421 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  48.87 
 
 
421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1280  acetate kinase  48.31 
 
 
418 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  48.87 
 
 
421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  48.98 
 
 
414 aa  404  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  51.39 
 
 
404 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  52.01 
 
 
397 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  51.9 
 
 
402 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  51.11 
 
 
406 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  51.87 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  49.37 
 
 
401 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1249  acetate kinase  49.37 
 
 
397 aa  392  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.407585  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  49.13 
 
 
402 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  48.98 
 
 
398 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  47.1 
 
 
414 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0469  acetate kinase  46.63 
 
 
419 aa  391  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0464018  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2294  acetate kinase  48.47 
 
 
395 aa  387  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  46.73 
 
 
399 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  46.92 
 
 
452 aa  380  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  0.0000000373865 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  48.88 
 
 
403 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1180  acetate kinase  47.09 
 
 
414 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1269  acetate kinase  45.94 
 
 
399 aa  379  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  47.61 
 
 
404 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  48.87 
 
 
399 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  48.35 
 
 
404 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  48.35 
 
 
404 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  48.35 
 
 
404 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  46.27 
 
 
394 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  48.11 
 
 
400 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  48.11 
 
 
413 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  48.61 
 
 
399 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  48.61 
 
 
399 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  48.35 
 
 
404 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  48.35 
 
 
404 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0168  acetate kinase  47.22 
 
 
397 aa  368  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.14758  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  48.11 
 
 
399 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  47.61 
 
 
399 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  47.61 
 
 
422 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  49.11 
 
 
394 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  47.74 
 
 
394 aa  370  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  47.61 
 
 
399 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  46.85 
 
 
400 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  47.38 
 
 
399 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  47.61 
 
 
399 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  47.61 
 
 
399 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>