More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2050 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 115 aa  226  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  76.52 
 
 		 115 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  72.17 
 
 		 115 aa  175  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  73.87 
 
 		 116 aa  174  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  72.73 
 
 		 118 aa  173  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  73.87 
 
 		 114 aa  171  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  73.87 
 
 		 114 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  73.87 
 
 		 114 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  73.87 
 
 		 114 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  73.87 
 
 		 114 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  73.87 
 
 		 114 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  73.87 
 
 		 114 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  73.87 
 
 		 114 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  73.87 
 
 		 114 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  73.87 
 
 		 114 aa  170  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  70.54 
 
 		 114 aa  169  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  72.07 
 
 		 114 aa  169  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  70.27 
 
 		 113 aa  168  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  70.27 
 
 		 116 aa  167  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  70.27 
 
 		 116 aa  167  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 128 aa  164  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  68.47 
 
 		 116 aa  163  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  67.57 
 
 		 121 aa  163  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  69.37 
 
 		 113 aa  162  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  69.03 
 
 		 115 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 117 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  65.49 
 
 		 114 aa  159  9e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  65.77 
 
 		 119 aa  158  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 118 aa  158  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  70.91 
 
 		 116 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  64.86 
 
 		 118 aa  158  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  68.18 
 
 		 116 aa  157  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  65.77 
 
 		 113 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  65.77 
 
 		 113 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  65.77 
 
 		 113 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  68.14 
 
 		 114 aa  157  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  65.77 
 
 		 116 aa  157  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 113 aa  157  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 114 aa  157  6e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  65.83 
 
 		 140 aa  156  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 118 aa  156  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 115 aa  156  8e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  66.95 
 
 		 131 aa  156  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 113 aa  156  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  67.24 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  63.06 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  65.77 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  64.55 
 
 		 114 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 113 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 118 aa  154  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  65 
 
 		 127 aa  154  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  67.24 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  67.24 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  67.59 
 
 		 114 aa  154  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  65.55 
 
 		 126 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  65.55 
 
 		 126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  65.52 
 
 		 183 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 118 aa  154  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 117 aa  153  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  65.14 
 
 		 120 aa  153  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 113 aa  153  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 118 aa  153  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  67.24 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  64.41 
 
 		 134 aa  151  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  64.41 
 
 		 134 aa  151  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 121 aa  152  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  63.06 
 
 		 119 aa  151  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  63.06 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 184 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  61.82 
 
 		 113 aa  150  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  64.41 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 115 aa  150  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  64.41 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 177 aa  150  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  64.04 
 
 		 115 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 180 aa  150  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  66.09 
 
 		 124 aa  150  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  62.71 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  63.89 
 
 		 119 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  66.36 
 
 		 117 aa  148  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  59.63 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 119 aa  147  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0348  ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 115 aa  147  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 119 aa  147  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 145 aa  146  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  61.34 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  65.14 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>