More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2041 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2041  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  340  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000212693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1210  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  57.03 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00161694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  40.15 
 
 		 139 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 		 139 aa  111  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  39.42 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  43.86 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0982  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.67 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  42.11 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1197  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  37.6 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1011  NADH dehydrogenase subunit I  34.15 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  40.65 
 
 		 194 aa  99  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1040  NADH dehydrogenase subunit I  34.15 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000326556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  33.12 
 
 		 207 aa  97.8  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  33.54 
 
 		 200 aa  97.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3746  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.4 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  38.21 
 
 		 215 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  39.02 
 
 		 218 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  39.02 
 
 		 218 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  35.52 
 
 		 185 aa  94.4  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.34 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  39.02 
 
 		 208 aa  94.4  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26891  NADH dehydrogenase subunit I  39.17 
 
 		 218 aa  94  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.52 
 
 		 165 aa  94  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  39.02 
 
 		 208 aa  94  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1578  NADH dehydrogenase subunit I  41.46 
 
 		 209 aa  94  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116678  normal  0.902926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  39.02 
 
 		 202 aa  94  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  39.02 
 
 		 208 aa  94  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1291  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.22 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  38.21 
 
 		 208 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40 
 
 		 132 aa  92.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1667  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40 
 
 		 132 aa  92.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  39.17 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  39.32 
 
 		 180 aa  91.3  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  38.14 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 169 aa  91.3  6e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  36.59 
 
 		 210 aa  90.9  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0401  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  40.68 
 
 		 194 aa  90.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0812  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.82 
 
 		 183 aa  91.3  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  39.17 
 
 		 163 aa  91.3  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  38.98 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  36.59 
 
 		 215 aa  90.9  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_799  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain I)  38.14 
 
 		 183 aa  90.9  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40 
 
 		 132 aa  90.9  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  38.98 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  41.74 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  38.98 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  38.98 
 
 		 167 aa  90.5  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.9 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  39.17 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  37.75 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1284  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.43 
 
 		 284 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 162 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  38.98 
 
 		 171 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  32.43 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  41.22 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.92 
 
 		 135 aa  88.6  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  38.98 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  38.14 
 
 		 177 aa  88.2  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 		 162 aa  88.2  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 162 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  38.14 
 
 		 167 aa  88.2  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 162 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 162 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  36.44 
 
 		 182 aa  87.8  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.72 
 
 		 149 aa  87.8  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891239  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 169 aa  87.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 		 162 aa  87.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 		 162 aa  87.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  40.68 
 
 		 170 aa  87.4  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.66 
 
 		 330 aa  87.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0279248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  39.83 
 
 		 162 aa  87.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0748  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.5 
 
 		 183 aa  87.4  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  38.14 
 
 		 162 aa  87  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  37.29 
 
 		 165 aa  87.4  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  40 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  39.66 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4569  formate hydrogenlyase complex iron-sulfur subunit  38.18 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>