254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2013 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  100 
 
 
283 aa  587  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  48.56 
 
 
247 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  47.41 
 
 
241 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  44.72 
 
 
245 aa  222  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  40.64 
 
 
275 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  37.97 
 
 
270 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  35.32 
 
 
348 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  33.78 
 
 
327 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  40.27 
 
 
241 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  35.71 
 
 
188 aa  99.4  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  33.82 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  33.82 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  33.82 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  33.82 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  37.89 
 
 
426 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  36.53 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  45.28 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  38.3 
 
 
241 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  36.2 
 
 
266 aa  92.4  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  30.8 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  40.62 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  33.72 
 
 
470 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  31.13 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  39.23 
 
 
263 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  35.19 
 
 
469 aa  86.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  27.95 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  26.48 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  30.36 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  36.36 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  30.99 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  32.28 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  32.28 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  32.28 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  27.94 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0607  IstB domain protein ATP-binding protein  25.2 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2418  DNA replication protein DnaC  29.82 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  29.84 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  24.64 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  30.34 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  23.91 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  28.08 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  25.91 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  31.87 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  24.28 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  24.28 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  35.4 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  26.26 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0806  AAA ATPase  32.9 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  26.54 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  28.52 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  28.52 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  26.63 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3264  primosomal protein DnaI  25.12 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0423883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  26.13 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1242  replicative DNA helicase loader DnaI  23.5 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1775  primosomal protein DnaI  24.58 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1741  primosomal protein DnaI  24.58 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  30.28 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4474  primosomal protein DnaI  27.04 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4309  primosomal protein DnaI  27.04 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4320  primosomal protein DnaI  27.04 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4822  primosomal protein DnaI  27.04 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4703  primosomal protein DnaI  27.04 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000143247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4693  primosomal protein DnaI  27.04 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.23235e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  27.04 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  25.98 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  27.04 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  30.23 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  30.23 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1247  primosomal protein DnaI  25 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  26.42 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  30.23 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  30.23 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  26.36 
 
 
331 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9836  transposase  26.57 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1416  primosomal protein DnaI  26.49 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0273394  hitchhiker  0.000000000000115155 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0041  DNA replication protein DnaC  25.54 
 
 
337 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  24.26 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  33.33 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  27.31 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  26.78 
 
 
259 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  25.33 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0122  primosomal protein DnaI  27.91 
 
 
337 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0444634  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0552  DNA replication protein DnaC  27.62 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000116033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4409  primosomal protein DnaI  26.58 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0531  replicative DNA helicase loader DnaI  26.89 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296741  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  28.79 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1274  hypothetical protein  29.55 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  30 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  31.98 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1870  prophage LambdaSa2, DNA replication protein DnaC, putative  33.1 
 
 
273 aa  59.3  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0707  IstB ATP binding domain-containing protein  25.11 
 
 
258 aa  59.3  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.164792  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3437  IstB ATP binding domain-containing protein  31.25 
 
 
259 aa  59.3  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.370706 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  22.53 
 
 
284 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  30.83 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  33.03 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  22.53 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  23.08 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl579  chromosomal replication initiator protein  28.44 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  23.78 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>