More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1982 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  100 
 
 
298 aa  617  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  56.15 
 
 
301 aa  340  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  51.32 
 
 
304 aa  314  1e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  6.63621e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  48.72 
 
 
317 aa  307  1e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  46.8 
 
 
299 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.82 
 
 
299 aa  271  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  48.79 
 
 
290 aa  271  8e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  43.29 
 
 
313 aa  271  9e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  6.34873e-09 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  45.18 
 
 
296 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.9 
 
 
299 aa  265  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.9 
 
 
299 aa  265  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.9497e-06  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.48 
 
 
298 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.9 
 
 
299 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.9 
 
 
299 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.85052e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.9 
 
 
299 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  43 
 
 
295 aa  263  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.9 
 
 
299 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.9 
 
 
299 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.07327e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.9 
 
 
299 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.91393e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.57 
 
 
301 aa  262  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.89449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.57 
 
 
299 aa  262  5e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  8.55714e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  45.57 
 
 
299 aa  261  8e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  46.92 
 
 
298 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  46.82 
 
 
342 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  43.67 
 
 
295 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  44.41 
 
 
307 aa  256  5e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  44.41 
 
 
307 aa  255  8e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.24 
 
 
296 aa  254  1e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.24 
 
 
296 aa  254  1e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  44.75 
 
 
307 aa  253  2e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.95 
 
 
296 aa  254  2e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  46 
 
 
343 aa  252  4e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.67 
 
 
296 aa  252  5e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  46 
 
 
343 aa  252  5e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  46.18 
 
 
311 aa  252  5e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.67 
 
 
296 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.67 
 
 
296 aa  252  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.67 
 
 
296 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.67 
 
 
296 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.91 
 
 
296 aa  251  8e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  3.17777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.57 
 
 
296 aa  251  9e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  44.41 
 
 
300 aa  251  9e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.57 
 
 
296 aa  251  9e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  42.33 
 
 
302 aa  249  4e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  8.94527e-13 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  40.67 
 
 
295 aa  247  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  42.57 
 
 
295 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  41.53 
 
 
294 aa  245  7e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  44.04 
 
 
302 aa  244  1e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  40.67 
 
 
305 aa  243  2e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  1.43659e-07  unclonable  2.74126e-08 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  41.33 
 
 
296 aa  244  2e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  41 
 
 
295 aa  242  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  41 
 
 
295 aa  242  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  41.75 
 
 
296 aa  242  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  44.19 
 
 
293 aa  241  8e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.69064e-10 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  40.66 
 
 
302 aa  241  9e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  42.71 
 
 
295 aa  241  9e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  42.52 
 
 
302 aa  240  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  42.76 
 
 
297 aa  240  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  42.52 
 
 
302 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  40.54 
 
 
296 aa  239  3e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  42.19 
 
 
302 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  43.85 
 
 
293 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  43.14 
 
 
306 aa  239  6e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  41.95 
 
 
294 aa  238  6e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  44.78 
 
 
294 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.37 
 
 
300 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  39.6 
 
 
308 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  41.86 
 
 
304 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  43.1 
 
 
294 aa  234  1e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.38339e-06  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  39.8 
 
 
296 aa  234  2e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  42.21 
 
 
332 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  42.14 
 
 
295 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.03 
 
 
300 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.17379e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  42.23 
 
 
295 aa  233  4e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  42.52 
 
 
294 aa  233  4e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  40.86 
 
 
295 aa  231  8e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.41024e-08 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  43.39 
 
 
302 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  41.47 
 
 
292 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  43.62 
 
 
294 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  37.26 
 
 
329 aa  228  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  41.08 
 
 
303 aa  229  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  40 
 
 
308 aa  228  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  40.74 
 
 
298 aa  228  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  40.74 
 
 
298 aa  228  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  42.47 
 
 
304 aa  228  7e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  40.13 
 
 
313 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  39.73 
 
 
292 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  40.98 
 
 
304 aa  228  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2478  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.05 
 
 
322 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0183983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  39.4 
 
 
320 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  39.74 
 
 
323 aa  226  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  41.55 
 
 
295 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  38 
 
 
303 aa  226  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.05 
 
 
322 aa  226  5e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  43.69 
 
 
296 aa  226  5e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  38.31 
 
 
291 aa  226  5e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.71 
 
 
318 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.71 
 
 
318 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.71 
 
 
318 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  39.26 
 
 
317 aa  224  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>