More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1953 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  100 
 
 
311 aa  636  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3184  riboflavin biosynthesis protein RibF  54.72 
 
 
311 aa  336  3e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.516481 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0930  riboflavin biosynthesis protein RibF  47.71 
 
 
308 aa  306  4e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0321744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1658  riboflavin biosynthesis protein RibF  50.98 
 
 
319 aa  283  2e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0904  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.51 
 
 
319 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3672  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.67 
 
 
318 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.31825e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3505  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  42.35 
 
 
314 aa  245  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5114  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.96 
 
 
314 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2195  normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  42.16 
 
 
320 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.97835e-07  hitchhiker  1.24783e-05 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1762  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.04 
 
 
314 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1187  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.89 
 
 
309 aa  234  1e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2234  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.07 
 
 
317 aa  230  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.56 
 
 
313 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3956  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.75 
 
 
324 aa  229  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.97 
 
 
314 aa  229  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.58 
 
 
312 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2384  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.58 
 
 
311 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1936  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  43.46 
 
 
309 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2437  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.46 
 
 
325 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3662  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.29 
 
 
309 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1654  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  43.11 
 
 
309 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2151  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.52 
 
 
330 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0987  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.93 
 
 
312 aa  222  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.83 
 
 
311 aa  222  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2517  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.89 
 
 
325 aa  221  1e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.24857  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2214  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.89 
 
 
313 aa  221  1e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00156337  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.06 
 
 
316 aa  221  1e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.45 
 
 
310 aa  220  2e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.59125e-05 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.62 
 
 
308 aa  219  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2129  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.12 
 
 
317 aa  219  4e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1159  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.93 
 
 
327 aa  219  4e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.87136e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14650  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  40.46 
 
 
313 aa  218  9e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0844225  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2196  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.71 
 
 
306 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3326  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.46 
 
 
313 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0873807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3557  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.89 
 
 
309 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.91 
 
 
312 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1388  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  36.93 
 
 
322 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47229  normal  0.722394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3549  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.29 
 
 
311 aa  214  1e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2686  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.58 
 
 
320 aa  213  2e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.17202e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0245  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.86 
 
 
314 aa  214  2e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.694964  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0641  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.56 
 
 
314 aa  213  3e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.967274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2051  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.44 
 
 
328 aa  213  3e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1416  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  40.07 
 
 
299 aa  213  3e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0461  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.24 
 
 
311 aa  213  5e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.890869  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0979  riboflavin biosynthesis protein RibF  40 
 
 
306 aa  212  5e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1487  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.6 
 
 
322 aa  212  6e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.038683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07880  FMN adenylyltransferase;riboflavin kinase  38.82 
 
 
307 aa  211  9e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.42 
 
 
311 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2304  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  40 
 
 
306 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2486  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.81 
 
 
314 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2927  riboflavin biosynthesis protein  39.03 
 
 
317 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0456269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3631  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.28 
 
 
323 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0225565  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3187  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  38.51 
 
 
310 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0757172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4025  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.82 
 
 
307 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2348  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.45 
 
 
324 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400291  hitchhiker  0.00462783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5827  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.86 
 
 
310 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3227  riboflavin biosynthesis protein RibF  38 
 
 
303 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1066  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.66 
 
 
315 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  0.0219323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1843  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.1 
 
 
316 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18679  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0947  bifunctional protein: riboflavin kinase; FAD synthetase  35.06 
 
 
309 aa  206  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2461  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.91 
 
 
323 aa  206  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.012862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1649  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.28 
 
 
315 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3946  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.91 
 
 
323 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3660  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.91 
 
 
323 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00940853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3820  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.91 
 
 
323 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3568  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.91 
 
 
323 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000147848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3550  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.91 
 
 
323 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2118  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.32 
 
 
352 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2071  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  38.06 
 
 
310 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.275327  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0799  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.62 
 
 
310 aa  202  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1379  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.66 
 
 
309 aa  202  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.672568  normal  0.471041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0612  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  36.69 
 
 
314 aa  202  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.115533 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3856  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.57 
 
 
323 aa  201  1e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.61391e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0923  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.17 
 
 
311 aa  201  1e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2358  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.18 
 
 
309 aa  201  1e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.154524 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1337  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.88 
 
 
323 aa  201  2e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.536973  hitchhiker  0.00905028 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1448  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.7 
 
 
316 aa  200  2e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.76726e-06  normal  0.276932 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3847  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.57 
 
 
323 aa  201  2e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2958  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  37.46 
 
 
311 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.29832e-06  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3137  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  37.46 
 
 
311 aa  200  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00248689  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3533  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.13 
 
 
311 aa  199  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2161  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.65 
 
 
323 aa  200  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0689935  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0200  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.42 
 
 
313 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3907  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.88 
 
 
323 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2965  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  40.61 
 
 
317 aa  199  4e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0760879  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1337  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.31 
 
 
309 aa  199  4e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107929  hitchhiker  0.00108968 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1155  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.48 
 
 
311 aa  199  4e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00349764  normal  0.220193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2599  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.62 
 
 
323 aa  199  4e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1053  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.48 
 
 
311 aa  199  4e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3040  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  37.13 
 
 
311 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00882094  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3179  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.13 
 
 
308 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0372  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  37.41 
 
 
321 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  2.76676e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1181  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.29 
 
 
306 aa  199  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1399  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.56 
 
 
323 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.804257  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.5 
 
 
311 aa  198  8e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0714  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.24 
 
 
369 aa  198  1e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  35.54 
 
 
307 aa  197  1e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1061  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.2 
 
 
317 aa  197  2e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2891  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.16 
 
 
311 aa  197  2e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831946  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1776  riboflavin kinase / FAD synthetase  37.06 
 
 
320 aa  197  2e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.143306  normal  0.170251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>