More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1913 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 389 aa  801    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  53.28 
 
 		 388 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  50.13 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.09 
 
 		 392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  51.3 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  50.91 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  49.1 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  48.42 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  50.78 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 		 400 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 		 400 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  50.65 
 
 		 399 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.87 
 
 		 389 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  50.78 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.48 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  50 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  50.26 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  49.62 
 
 		 390 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  50 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  48.55 
 
 		 382 aa  393  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.28 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.74 
 
 		 390 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  49.21 
 
 		 382 aa  388  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.69 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  47.76 
 
 		 384 aa  386  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  47.52 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  45.93 
 
 		 400 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  46.7 
 
 		 385 aa  373  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.61 
 
 		 392 aa  368  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  46.19 
 
 		 402 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  44.88 
 
 		 403 aa  363  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  45.85 
 
 		 401 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  45.97 
 
 		 391 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.6 
 
 		 389 aa  362  9e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  45.71 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  45.71 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  44.74 
 
 		 392 aa  356  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  42.38 
 
 		 391 aa  353  4e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.38 
 
 		 390 aa  352  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  41.54 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  42.45 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.83 
 
 		 388 aa  348  6e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  44.21 
 
 		 390 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  43.94 
 
 		 392 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.75 
 
 		 387 aa  343  2e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  41.79 
 
 		 400 aa  343  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  42.82 
 
 		 390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  41.41 
 
 		 395 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  41.19 
 
 		 392 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  43.9 
 
 		 384 aa  342  1e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  42.56 
 
 		 409 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  44.27 
 
 		 388 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  40.62 
 
 		 390 aa  339  5.9999999999999996e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  40.67 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  42.04 
 
 		 402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  42.27 
 
 		 404 aa  334  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  42.3 
 
 		 399 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  41.51 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  41.51 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  41.51 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  42.3 
 
 		 418 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  41.25 
 
 		 402 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1794  succinyldiaminopimelate transaminase  39.69 
 
 		 392 aa  332  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  40.99 
 
 		 402 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  41.51 
 
 		 402 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  40.99 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  40.99 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  42.04 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  40.99 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  40.99 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0292  aspartate aminotransferase  40.93 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  40.99 
 
 		 412 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  40.73 
 
 		 411 aa  330  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  41.25 
 
 		 403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1106  aspartate aminotransferase  40.05 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  41.67 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  41.67 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  40.99 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  42.64 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  40.73 
 
 		 409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0501  aminotransferase  42.89 
 
 		 413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1145  aspartate aminotransferase  40.41 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  40.99 
 
 		 411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  40.21 
 
 		 413 aa  327  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  43.12 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  40.47 
 
 		 412 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  43.94 
 
 		 389 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0082  aminotransferase  41.51 
 
 		 428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0510162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  44.41 
 
 		 395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0168  aminotransferase class I and II  40.93 
 
 		 403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.391722  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  40.47 
 
 		 412 aa  326  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  40.47 
 
 		 412 aa  326  5e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  40.47 
 
 		 412 aa  326  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  42.93 
 
 		 396 aa  326  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  40.47 
 
 		 412 aa  326  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  40.47 
 
 		 412 aa  326  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  40.47 
 
 		 412 aa  325  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>