259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1866 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  736    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  44.71 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  45.48 
 
 		 369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  44.03 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  35.79 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  36.68 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  37.91 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  31.77 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  29.01 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  33.79 
 
 		 327 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  30.74 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  30.74 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  30.22 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  29.08 
 
 		 352 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  29.97 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  27.67 
 
 		 352 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  31.79 
 
 		 348 aa  126  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  29.32 
 
 		 355 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  28.39 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  31.03 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  30.54 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  27.5 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  27.71 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  28.12 
 
 		 377 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  30.03 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  25.54 
 
 		 419 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  27.15 
 
 		 421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  27.48 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  28.72 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  30.13 
 
 		 357 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  30.77 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  29.74 
 
 		 449 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  30.3 
 
 		 355 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  29.23 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  24.75 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  27.69 
 
 		 442 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  28.53 
 
 		 582 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  27.24 
 
 		 335 aa  103  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  27.74 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  27.56 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  27.3 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  25.99 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  27.57 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  29.63 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  29.63 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  29.63 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  29.63 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  29.63 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  29.63 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  29.63 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  25.7 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  29.63 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  25.08 
 
 		 434 aa  99.8  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  27.32 
 
 		 346 aa  99.8  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  25.55 
 
 		 569 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  28.71 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  27.8 
 
 		 445 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  27.8 
 
 		 445 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  28.2 
 
 		 315 aa  97.1  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  29.53 
 
 		 346 aa  96.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  30.25 
 
 		 593 aa  96.7  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  25.56 
 
 		 340 aa  95.9  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  26 
 
 		 328 aa  96.3  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  27.99 
 
 		 339 aa  96.3  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1780  hypothetical protein  27.16 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0136409  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  26.35 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  27.8 
 
 		 375 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  29.97 
 
 		 349 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  29.63 
 
 		 349 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  29.63 
 
 		 349 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  26.89 
 
 		 473 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  29.63 
 
 		 349 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0756  hypothetical protein  29.83 
 
 		 331 aa  93.2  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  29.63 
 
 		 349 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  27.21 
 
 		 473 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  29.47 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  29.39 
 
 		 361 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  29.47 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  29.47 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  26.64 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  27.9 
 
 		 325 aa  92  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  28.85 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  25.65 
 
 		 316 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  24.19 
 
 		 348 aa  91.3  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  26.57 
 
 		 284 aa  91.3  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  25.16 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  27.63 
 
 		 322 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  26.67 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  27.24 
 
 		 341 aa  90.9  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  25.9 
 
 		 380 aa  90.5  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  25.51 
 
 		 318 aa  90.1  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  26.09 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  26.09 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  27.59 
 
 		 347 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  25.57 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  25.57 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  25.95 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  24.84 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  26.74 
 
 		 593 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>