More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1812 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1049  ABC transporter, ATP-binding protein  59.8 
 
 
513 aa  665    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1812  ABC transporter related  100 
 
 
518 aa  1064    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1384  ABC transporter related  76.64 
 
 
518 aa  853    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000721481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3134  ABC transporter related  77.99 
 
 
518 aa  842    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000407492  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1259  ABC transporter ATPase  61.06 
 
 
512 aa  659    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0362  ABC transporter related  58.8 
 
 
517 aa  669    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0008233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0780  ABC transporter related  82.43 
 
 
518 aa  899    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  66.02 
 
 
518 aa  735    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  66.22 
 
 
518 aa  738    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3951  ABC transporter-related protein  57.2 
 
 
517 aa  630  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5564  ABC transporter, ATP-binding protein  57 
 
 
530 aa  625  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5391  ABC transporter ATP-binding protein uup  57.2 
 
 
517 aa  625  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5225  ABC transporter related  56.81 
 
 
517 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5614  ABC transporter ATP-binding protein uup  57 
 
 
517 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5556  ABC transporter, ATP-binding protein  56.98 
 
 
517 aa  624  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.39 
 
 
517 aa  620  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5281  ABC transporter ATP-binding protein  56.81 
 
 
517 aa  614  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5125  ABC transporter, ATP-binding protein  56.81 
 
 
517 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.525386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5678  ABC transporter ATP-binding protein  56.81 
 
 
517 aa  614  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5524  ABC transporter, ATP-binding protein  56.81 
 
 
517 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0085  ABC transporter ATPase  57.34 
 
 
517 aa  606  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0495  ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 
514 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0365  ABC transporter related  52.05 
 
 
510 aa  524  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0361  ABC transporter, ATP-binding protein  50.58 
 
 
514 aa  518  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0497  ABC transporter, ATP-binding protein  50.58 
 
 
514 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0358  ABC transporter, ATP-binding protein  50.39 
 
 
514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4875  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 
514 aa  511  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.870616  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0370  ABC transporter ATP-binding protein  50.78 
 
 
514 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0384  ABC transporter ATP-binding protein  50.78 
 
 
514 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0427  ABC transporter, ATP-binding protein  50.78 
 
 
514 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5240  ABC transporter, ATP-binding protein  42.77 
 
 
515 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0023  ABC transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 
515 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.190618 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0123  ABC transporter, ATP-binding protein  43.47 
 
 
512 aa  422  1e-117  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.608818  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1433  ABC transporter ATPase  40.94 
 
 
523 aa  422  1e-117  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1711  ABC transporter ATPase  44.55 
 
 
515 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000524631 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl053  multidrug ABC transporter ATP-binding component  41.99 
 
 
512 aa  409  1e-113  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1915  ABC transporter ATPase  39.4 
 
 
518 aa  404  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1814  ABC transporter related  39.26 
 
 
513 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002191  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  39.68 
 
 
523 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.742712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1037  ABC transporter related  42.06 
 
 
510 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4364  ABC transporter related  39.15 
 
 
519 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  38.27 
 
 
644 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  37.4 
 
 
645 aa  362  1e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  37.19 
 
 
641 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  37.19 
 
 
643 aa  354  2e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  35.92 
 
 
636 aa  353  4e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  36.45 
 
 
635 aa  352  8e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  37.28 
 
 
659 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  36.89 
 
 
658 aa  343  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  36.59 
 
 
639 aa  341  2e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  35.45 
 
 
639 aa  341  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  36.94 
 
 
644 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  36.29 
 
 
636 aa  340  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  36.8 
 
 
638 aa  339  7e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 
659 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
644 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 
662 aa  336  5e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  36.5 
 
 
658 aa  337  5e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
640 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 
658 aa  336  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  36.31 
 
 
658 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 
658 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  36.7 
 
 
575 aa  330  4e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 
632 aa  329  9e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  34.88 
 
 
634 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  35.53 
 
 
564 aa  324  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  36.15 
 
 
666 aa  325  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  35.32 
 
 
535 aa  323  5e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  35.48 
 
 
634 aa  323  6e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  35.08 
 
 
642 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  35.08 
 
 
642 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  34.93 
 
 
668 aa  318  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  36.52 
 
 
630 aa  318  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  34.3 
 
 
646 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  36.85 
 
 
581 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 
643 aa  316  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 
644 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  34.63 
 
 
649 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  36.85 
 
 
643 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  35.21 
 
 
690 aa  314  2.9999999999999996e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  35.42 
 
 
641 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  34.67 
 
 
549 aa  312  9e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  36.31 
 
 
567 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 
645 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  35.78 
 
 
656 aa  306  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  34.79 
 
 
767 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  34.12 
 
 
543 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  32.48 
 
 
545 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  33.9 
 
 
544 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  33.46 
 
 
544 aa  303  7.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  34.06 
 
 
540 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  34.95 
 
 
564 aa  301  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  34.33 
 
 
560 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  33.47 
 
 
540 aa  299  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.3 
 
 
645 aa  299  9e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  33.47 
 
 
540 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  33.47 
 
 
540 aa  297  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  34.36 
 
 
645 aa  297  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  32.5 
 
 
630 aa  297  3e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  34.12 
 
 
540 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>