More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1736 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1736  thioredoxin reductase  100 
 
 		 307 aa  620  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000141023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  64.91 
 
 		 306 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  56.81 
 
 		 304 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  54.97 
 
 		 323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  54.03 
 
 		 306 aa  330  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  53.14 
 
 		 304 aa  331  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  51.49 
 
 		 309 aa  324  9e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  51.47 
 
 		 326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  50.84 
 
 		 308 aa  311  6.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  49.5 
 
 		 308 aa  308  5e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  47.7 
 
 		 334 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  50.66 
 
 		 306 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  47.16 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  48.18 
 
 		 312 aa  296  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  49.18 
 
 		 315 aa  295  7e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.47 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  48.52 
 
 		 312 aa  292  4e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  50.84 
 
 		 304 aa  292  4e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  49.18 
 
 		 318 aa  292  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  49.5 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  46.25 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  44.97 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  48.01 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  47.87 
 
 		 318 aa  289  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  47.08 
 
 		 316 aa  287  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  46.08 
 
 		 311 aa  286  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  47.35 
 
 		 409 aa  286  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  48.01 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  46.51 
 
 		 310 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.19 
 
 		 407 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  49.34 
 
 		 340 aa  285  5.999999999999999e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  47.67 
 
 		 324 aa  285  8e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  46.56 
 
 		 318 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  46.23 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  46.23 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  46.23 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  46.23 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  46.23 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  46.23 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  46.23 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  46.23 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  48.05 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  46.08 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  46.91 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  46.91 
 
 		 311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  46.56 
 
 		 318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  48.05 
 
 		 327 aa  282  4.0000000000000003e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  46.91 
 
 		 318 aa  282  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  47.04 
 
 		 308 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  48.68 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  45.72 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  46.73 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  47.54 
 
 		 331 aa  279  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  46.38 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  46.03 
 
 		 332 aa  278  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  46.08 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  45.57 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  46.43 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  42.95 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  47.19 
 
 		 320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  46.41 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  45.6 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  45.03 
 
 		 314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  45.86 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  45.03 
 
 		 314 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  43.29 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  44.12 
 
 		 310 aa  272  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  45.64 
 
 		 317 aa  271  7e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  45.72 
 
 		 311 aa  271  8.000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.48 
 
 		 427 aa  271  9e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  45.57 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  42.95 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  44.88 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  45.64 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  47.35 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  42.62 
 
 		 306 aa  269  5e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  47.02 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  46.56 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  44.63 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  47.95 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  45.21 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  45.21 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  44.19 
 
 		 330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  46.45 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  45.21 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2943  thioredoxin reductase  43.23 
 
 		 333 aa  265  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  44.37 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  43.14 
 
 		 318 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  43.75 
 
 		 310 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  44.92 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  43.93 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  45.07 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  45.57 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  45.51 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  45.15 
 
 		 302 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  43.97 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  46.9 
 
 		 317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000408634  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  45.71 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  43.93 
 
 		 311 aa  258  7e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  42.62 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>