More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1724 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  477  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  71.67 
 
 		 234 aa  342  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  71.37 
 
 		 233 aa  339  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  69.66 
 
 		 234 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  70.94 
 
 		 233 aa  337  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  69.53 
 
 		 234 aa  336  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  68.38 
 
 		 235 aa  332  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  67.81 
 
 		 239 aa  328  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  65.81 
 
 		 237 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  67.09 
 
 		 235 aa  325  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  66.95 
 
 		 235 aa  321  8e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  63.68 
 
 		 236 aa  318  3.9999999999999996e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  64.96 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  63.95 
 
 		 234 aa  314  8e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  67.95 
 
 		 238 aa  310  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  65.24 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  63.52 
 
 		 237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  65.24 
 
 		 236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  64.38 
 
 		 234 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  63.09 
 
 		 236 aa  304  7e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  64.96 
 
 		 256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  63.52 
 
 		 237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  63.68 
 
 		 238 aa  301  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  62.23 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  61.11 
 
 		 236 aa  300  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  61.37 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  62.39 
 
 		 258 aa  298  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  64.96 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  62.39 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  61.37 
 
 		 233 aa  295  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  61.97 
 
 		 239 aa  295  5e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  57.69 
 
 		 238 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  61.97 
 
 		 236 aa  293  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  60.09 
 
 		 235 aa  291  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  59.66 
 
 		 235 aa  291  8e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  61.37 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1086  ABC transporter related  65.38 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0710157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  61.7 
 
 		 236 aa  289  3e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  59.4 
 
 		 238 aa  289  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  65.11 
 
 		 245 aa  288  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  59.4 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  59.83 
 
 		 238 aa  287  9e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  59.57 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  58.12 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  59.4 
 
 		 235 aa  286  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  57.51 
 
 		 260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  60.85 
 
 		 242 aa  285  5e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  57.94 
 
 		 237 aa  284  8e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  60.26 
 
 		 236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  60.52 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  59.66 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  58.62 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  55.13 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  61.86 
 
 		 239 aa  281  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  54.27 
 
 		 238 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2953  ABC transporter related  60.26 
 
 		 251 aa  281  8.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.680743  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.27 
 
 		 238 aa  281  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  54.7 
 
 		 238 aa  281  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  57.26 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  56.65 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  57.02 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  58.12 
 
 		 239 aa  279  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  54.27 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  54.27 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  57.08 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  55.56 
 
 		 237 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 234 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  56.22 
 
 		 239 aa  278  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  56.84 
 
 		 265 aa  278  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  53.85 
 
 		 238 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  57.87 
 
 		 243 aa  278  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.85 
 
 		 238 aa  278  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  53.42 
 
 		 238 aa  278  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  52.99 
 
 		 238 aa  277  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  56.22 
 
 		 234 aa  277  9e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  58.97 
 
 		 237 aa  277  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  53.42 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  53.42 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  53.42 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  53.42 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0615  ABC transporter related  57.51 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.109789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  56.6 
 
 		 242 aa  275  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  56.6 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  53.42 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  53.42 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  53.19 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  53.19 
 
 		 238 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  56.84 
 
 		 235 aa  275  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  53.42 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.56 
 
 		 235 aa  275  5e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  60.17 
 
 		 239 aa  275  5e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 234 aa  275  6e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.42 
 
 		 244 aa  274  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  55.74 
 
 		 242 aa  274  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>