More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1712 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  100 
 
 
441 aa  872    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  60.05 
 
 
426 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.55 
 
 
954 aa  320  5e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  47.33 
 
 
405 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.97 
 
 
924 aa  314  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  43.57 
 
 
429 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  43.56 
 
 
428 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  42.62 
 
 
921 aa  297  2e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  43.67 
 
 
470 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  42.61 
 
 
469 aa  296  6e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  43.07 
 
 
470 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  43.07 
 
 
470 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  43.07 
 
 
470 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  39.36 
 
 
472 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  43.98 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  44.44 
 
 
439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  42.74 
 
 
933 aa  283  5.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  43.18 
 
 
480 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  43.05 
 
 
487 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  40.81 
 
 
468 aa  280  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  39.05 
 
 
498 aa  276  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  41.03 
 
 
414 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  42.53 
 
 
472 aa  274  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  40.91 
 
 
422 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  37.81 
 
 
462 aa  269  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  39.37 
 
 
496 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  37.84 
 
 
517 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  39.57 
 
 
460 aa  266  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  38.52 
 
 
493 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  38.6 
 
 
533 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  37.62 
 
 
529 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  38.98 
 
 
459 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  39.37 
 
 
476 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  41.03 
 
 
563 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  38.71 
 
 
422 aa  260  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  39.21 
 
 
443 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  37.76 
 
 
459 aa  259  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  39.32 
 
 
443 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  40.48 
 
 
457 aa  256  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  38.71 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  39.84 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  41.69 
 
 
475 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  39.78 
 
 
474 aa  249  7e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  39.43 
 
 
496 aa  249  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  39.8 
 
 
543 aa  247  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  39.53 
 
 
399 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  36.19 
 
 
435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  38.93 
 
 
469 aa  245  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  37.92 
 
 
487 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  36.68 
 
 
463 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  41.57 
 
 
473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  38.96 
 
 
444 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  35.68 
 
 
496 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  36.39 
 
 
519 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  37.19 
 
 
493 aa  240  4e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  37.95 
 
 
463 aa  236  6e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  38.42 
 
 
409 aa  236  9e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  35.12 
 
 
517 aa  233  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  37.85 
 
 
409 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  35.73 
 
 
972 aa  219  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  38.07 
 
 
494 aa  216  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  40.21 
 
 
481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  33.08 
 
 
659 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  38.3 
 
 
367 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  32.85 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  38.33 
 
 
480 aa  183  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  38.3 
 
 
371 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  37.94 
 
 
420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  37.92 
 
 
364 aa  180  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  36.94 
 
 
365 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  37.5 
 
 
423 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  33.77 
 
 
386 aa  176  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  36.36 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  36.04 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  35.27 
 
 
368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1389  cell division protein FtsW  33.97 
 
 
385 aa  173  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1432  cell division protein FtsW  33.7 
 
 
385 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  36.51 
 
 
374 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3384  cell division protein FtsW  34.41 
 
 
395 aa  169  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.319796  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  34.22 
 
 
377 aa  169  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  32.84 
 
 
412 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  33.33 
 
 
378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  33.6 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  34.64 
 
 
365 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2474  cell cycle protein  32.95 
 
 
376 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0482  cell division protein FtsW  32.45 
 
 
370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000160421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  35.17 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0825  cell cycle protein  35.26 
 
 
364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0999607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  34.59 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  37.88 
 
 
366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  32.12 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  35.5 
 
 
424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  32.74 
 
 
361 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  37.89 
 
 
374 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2869  cell division membrane protein-like protein  33.33 
 
 
441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488582  normal  0.643206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3771  cell division protein FtsW  35.99 
 
 
432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.351351  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  34.14 
 
 
511 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  34.14 
 
 
511 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  34.14 
 
 
511 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  34.08 
 
 
388 aa  163  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>