More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1707 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1707  sun protein  100 
 
 
453 aa  942  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  62.22 
 
 
452 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  62.97 
 
 
452 aa  615  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  56.82 
 
 
452 aa  543  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  51.45 
 
 
457 aa  468  1e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  46.29 
 
 
449 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  46.86 
 
 
455 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  49.67 
 
 
453 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  43.27 
 
 
447 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  43.56 
 
 
448 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.93735e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  40.67 
 
 
444 aa  361  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  40.89 
 
 
444 aa  356  4e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  42.35 
 
 
448 aa  354  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  42.13 
 
 
448 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  41.94 
 
 
451 aa  350  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  40.84 
 
 
444 aa  349  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  40.62 
 
 
444 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  40.62 
 
 
444 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  40.62 
 
 
444 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  40.62 
 
 
444 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  40.18 
 
 
444 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  42.49 
 
 
448 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  41.06 
 
 
444 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  40.98 
 
 
444 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  5.12112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  40.18 
 
 
444 aa  346  5e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  40.62 
 
 
444 aa  345  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  38.84 
 
 
462 aa  345  9e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  42.35 
 
 
446 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  40.31 
 
 
444 aa  343  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  41.33 
 
 
452 aa  342  7e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  38.75 
 
 
456 aa  322  6e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  38.84 
 
 
446 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  38.72 
 
 
451 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  38.07 
 
 
452 aa  316  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  38.98 
 
 
451 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  38.69 
 
 
440 aa  315  9e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  38.24 
 
 
449 aa  313  4e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  39.12 
 
 
451 aa  312  7e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.25 
 
 
449 aa  312  9e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  40.04 
 
 
464 aa  310  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  38.51 
 
 
453 aa  309  8e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  37.95 
 
 
443 aa  307  2e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  36.22 
 
 
443 aa  307  2e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  37.19 
 
 
442 aa  306  5e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  36.24 
 
 
435 aa  306  6e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  37.42 
 
 
442 aa  305  8e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  40.95 
 
 
451 aa  302  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  35.53 
 
 
435 aa  299  9e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  35.53 
 
 
435 aa  299  9e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  38.44 
 
 
449 aa  293  3e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  38.39 
 
 
453 aa  293  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  38.03 
 
 
447 aa  286  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  36.83 
 
 
468 aa  283  3e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.76 
 
 
424 aa  279  8e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  38.36 
 
 
445 aa  278  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  36.38 
 
 
440 aa  277  3e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  35.48 
 
 
449 aa  270  3e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.62 
 
 
438 aa  270  6e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.98868e-06 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  37.83 
 
 
442 aa  265  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  35.7 
 
 
451 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.64 
 
 
448 aa  261  2e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  35.87 
 
 
452 aa  259  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  35.1 
 
 
444 aa  256  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.38 
 
 
429 aa  253  5e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  34.26 
 
 
430 aa  252  7e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  35.76 
 
 
439 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  35.03 
 
 
432 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  37.35 
 
 
450 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  34.58 
 
 
448 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0591  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.6 
 
 
442 aa  243  4e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.14 
 
 
438 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  34.13 
 
 
438 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  33.65 
 
 
430 aa  240  5e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  35.42 
 
 
501 aa  239  7e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  36.36 
 
 
445 aa  238  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  33.89 
 
 
438 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  35.92 
 
 
431 aa  236  5e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  33.65 
 
 
438 aa  236  5e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  35.44 
 
 
431 aa  236  7e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.85655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  33.75 
 
 
437 aa  235  1e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  33.11 
 
 
436 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  32.23 
 
 
428 aa  230  4e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.76 
 
 
445 aa  230  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  32.78 
 
 
406 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  33.56 
 
 
436 aa  229  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.73 
 
 
437 aa  223  5e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  39.31 
 
 
447 aa  222  1e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  35.98 
 
 
455 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  32.73 
 
 
471 aa  219  8e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  32.37 
 
 
427 aa  219  8e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  35.86 
 
 
455 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  33.04 
 
 
431 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  34.27 
 
 
434 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2869  sun protein  35.38 
 
 
433 aa  216  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  35.63 
 
 
455 aa  215  2e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.92 
 
 
427 aa  215  2e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.55 
 
 
424 aa  214  3e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  32.81 
 
 
428 aa  213  6e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  33.56 
 
 
429 aa  213  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  33.63 
 
 
429 aa  213  8e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>