More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1703 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3911  primosome assembly protein PriA  44.09 
 
 
801 aa  638    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3719  primosome assembly protein PriA  43.97 
 
 
801 aa  635    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3609  primosome assembly protein PriA  43.97 
 
 
801 aa  635    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3627  primosome assembly protein PriA  43.97 
 
 
801 aa  636    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1758  primosomal protein N'  45.07 
 
 
732 aa  636    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4006  primosome assembly protein PriA  43.97 
 
 
801 aa  635    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3882  primosome assembly protein PriA  43.97 
 
 
801 aa  635    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000345063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1703  primosomal protein N'  100 
 
 
732 aa  1505    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1594  primosomal protein N'  47.36 
 
 
735 aa  665    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  48.72 
 
 
747 aa  712    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3916  primosome assembly protein PriA  44.04 
 
 
801 aa  640    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000142044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3967  primosome assembly protein PriA  43.55 
 
 
801 aa  633  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1276  primosome assembly protein PriA  43.3 
 
 
801 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  44.05 
 
 
745 aa  631  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0779  primosomal protein N'  42.2 
 
 
802 aa  617  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3691  primosome assembly protein PriA  43.1 
 
 
801 aa  618  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  42.73 
 
 
801 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0856  primosomal protein N'  44.74 
 
 
730 aa  601  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.44655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1061  primosome assembly protein PriA  50.49 
 
 
804 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.964371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1271  primosomal protein N'  49.48 
 
 
802 aa  585  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.58065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3854  primosomal protein N'  42.15 
 
 
775 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0030151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2520  primosome assembly protein PriA  50.95 
 
 
801 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0370343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1296  primosomal protein N'  49.48 
 
 
802 aa  585  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  39.19 
 
 
815 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1716  primosome assembly protein PriA  41 
 
 
731 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0315  primosome assembly protein PriA  39.47 
 
 
796 aa  558  1e-157  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169363  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1332  primosomal protein N'  41.36 
 
 
749 aa  556  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000143785  normal  0.287743 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1173  replication restart DNA helicase PriA  50.09 
 
 
809 aa  556  1e-157  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1998  primosome assembly protein PriA  40.46 
 
 
731 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1515  replication restart DNA helicase PriA  39.1 
 
 
803 aa  549  1e-155  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2156  primosome assembly protein PriA  39.62 
 
 
781 aa  545  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1527  primosomal protein N'  38.66 
 
 
818 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590711  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1374  primosomal protein N'  39.68 
 
 
768 aa  537  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2493  primosomal protein N'  38.62 
 
 
792 aa  533  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2792  primosomal protein N'  40.35 
 
 
745 aa  532  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0760  primosomal protein N'  47.07 
 
 
798 aa  527  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000570984  hitchhiker  0.00000745488 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1396  primosome assembly protein PriA  46.38 
 
 
798 aa  528  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2810  primosomal protein N'  38.9 
 
 
758 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0869  primosomal protein N'  41.42 
 
 
770 aa  520  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2703  primosomal protein N'  46.39 
 
 
866 aa  519  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  39.12 
 
 
752 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1240  primosomal protein N'  45.59 
 
 
868 aa  512  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_278  primosomal protein N, (replication factor Y) (superfamily II helicase)  44.6 
 
 
815 aa  512  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0311908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  38.66 
 
 
752 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  44.57 
 
 
825 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2612  primosomal protein N'  39.04 
 
 
744 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1038  primosomal protein N'  38.16 
 
 
724 aa  503  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  40.58 
 
 
754 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  50.57 
 
 
806 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0786  replication restart DNA helicase PriA  47.06 
 
 
803 aa  504  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.823514  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1308  primosomal protein N'  38.75 
 
 
780 aa  500  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.368616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0764  primosomal protein N'  39.33 
 
 
732 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000407652  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3986  primosomal protein N'  47.44 
 
 
848 aa  502  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0672  primosomal protein N'  44.01 
 
 
835 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593856 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  44.71 
 
 
835 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  44.01 
 
 
843 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  47.17 
 
 
805 aa  497  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0337  primosomal protein N'  45.26 
 
 
815 aa  495  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.566686  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08420  primosomal protein N'  37.45 
 
 
786 aa  493  9.999999999999999e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.181256  normal  0.746709 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1197  primosome assembly protein PriA  42.86 
 
 
849 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2915  primosome assembly protein PriA  42.52 
 
 
914 aa  492  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.1983  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0567  primosome assembly protein PriA  47.83 
 
 
836 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.973651  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3774  replication restart DNA helicase PriA  35.98 
 
 
813 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0372203  normal  0.148217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4104  primosomal protein N'  44.67 
 
 
829 aa  486  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  37.73 
 
 
746 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2052  primosomal protein N'  43.08 
 
 
828 aa  482  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0025  primosomal protein N'  45.34 
 
 
679 aa  483  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0043  primosomal protein N'  39.22 
 
 
738 aa  485  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.401318 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09880  primosomal protein N'  38.07 
 
 
695 aa  481  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.738581  hitchhiker  0.00505641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1233  primosomal protein N  43.41 
 
 
802 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109325  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0316  primosomal protein N'  44.66 
 
 
815 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0460314  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0764  primosomal protein N'  38.69 
 
 
736 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0896  replication restart DNA helicase PriA  48.24 
 
 
821 aa  475  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0600783  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0727  replication restart DNA helicase PriA  39.1 
 
 
736 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0770  primosomal protein N'  40.16 
 
 
735 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.654251  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0974  primosomal protein N'  44.2 
 
 
661 aa  475  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000534713  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0764  primosomal protein N'  38.56 
 
 
736 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129915  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0948  primosomal protein n  42.76 
 
 
810 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.434554  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1417  primosomal protein N'  41.69 
 
 
810 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5549  primosomal protein N'  42.81 
 
 
858 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.293579  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0828  primosomal protein n  42.38 
 
 
815 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3737  replication restart DNA helicase PriA  37.09 
 
 
738 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03820  primosome assembly protein PriA  37.08 
 
 
732 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4050  primosomal protein N'  37.08 
 
 
732 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0959  primosomal protein N'  34.21 
 
 
790 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  36.59 
 
 
751 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1430  primosomal protein N'  40.81 
 
 
812 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03769  hypothetical protein  37.08 
 
 
732 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0117  primosome assembly protein PriA  38 
 
 
732 aa  462  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1169  primosomal protein N'  39.74 
 
 
811 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.807249  normal  0.476891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4311  primosome assembly protein PriA  37.92 
 
 
732 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4471  primosome assembly protein PriA  36.95 
 
 
732 aa  456  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1511  primosomal protein N'  41.59 
 
 
812 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4341  primosome assembly protein PriA  37.7 
 
 
732 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.849244  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4377  primosome assembly protein PriA  36.95 
 
 
732 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.679343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4427  primosome assembly protein PriA  37.83 
 
 
732 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3794  primosome assembly protein PriA  38.25 
 
 
731 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4418  primosome assembly protein PriA  36.68 
 
 
732 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4083  primosome assembly protein PriA  36.95 
 
 
732 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4425  primosome assembly protein PriA  37.7 
 
 
732 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.981494  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>