More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1695 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 392 aa  800    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  66.15 
 
 		 391 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  67.95 
 
 		 390 aa  554  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  69.39 
 
 		 392 aa  552  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  59.64 
 
 		 389 aa  489  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  56.14 
 
 		 388 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  54.81 
 
 		 388 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  54.86 
 
 		 390 aa  460  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  55.64 
 
 		 388 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  58.01 
 
 		 382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  54.35 
 
 		 382 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.5 
 
 		 385 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  53.11 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  55.03 
 
 		 384 aa  435  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.99 
 
 		 387 aa  431  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  53.44 
 
 		 382 aa  431  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.77 
 
 		 389 aa  425  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  54.11 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.36 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.07 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.85 
 
 		 385 aa  420  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.43 
 
 		 388 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  52.6 
 
 		 387 aa  418  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  48.29 
 
 		 386 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  49.09 
 
 		 389 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  50.26 
 
 		 384 aa  396  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  46.34 
 
 		 400 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  47.89 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  47.37 
 
 		 402 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.95 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  45.65 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  45.81 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  45.03 
 
 		 394 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  45.03 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  46.84 
 
 		 388 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  45.14 
 
 		 392 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  44.42 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  43.6 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  44.24 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  44.83 
 
 		 389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  44.5 
 
 		 394 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  40.89 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  45.87 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  41.84 
 
 		 409 aa  349  6e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  41.97 
 
 		 399 aa  346  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  40.77 
 
 		 395 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  42.78 
 
 		 392 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  42.11 
 
 		 399 aa  345  8.999999999999999e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  42.75 
 
 		 399 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  42.93 
 
 		 396 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  40.42 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  41.21 
 
 		 393 aa  344  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  43.04 
 
 		 392 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  42.78 
 
 		 406 aa  343  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  41.21 
 
 		 393 aa  344  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  41.3 
 
 		 421 aa  343  4e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  42.52 
 
 		 392 aa  342  5e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  42.52 
 
 		 392 aa  342  5e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  42.52 
 
 		 392 aa  342  5e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  42.52 
 
 		 392 aa  342  5e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  41.97 
 
 		 399 aa  342  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  42.82 
 
 		 425 aa  342  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  41.97 
 
 		 399 aa  342  8e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  41.67 
 
 		 403 aa  342  8e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  42.52 
 
 		 392 aa  342  9e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  42.49 
 
 		 400 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  42.78 
 
 		 392 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  41.71 
 
 		 399 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  41.65 
 
 		 407 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  42.49 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  42.52 
 
 		 392 aa  339  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  40.42 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  41.97 
 
 		 399 aa  338  7e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  41.3 
 
 		 393 aa  338  9e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  41.97 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  40.16 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  43.9 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  41.71 
 
 		 400 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  41.71 
 
 		 399 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  40.26 
 
 		 393 aa  335  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  40.78 
 
 		 400 aa  332  6e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  42.89 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0501  aminotransferase  41.67 
 
 		 413 aa  329  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  41.73 
 
 		 407 aa  329  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  39.23 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0864  aminotransferase  42.03 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.565347  normal  0.675575 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  40.87 
 
 		 407 aa  326  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  40.87 
 
 		 406 aa  325  7e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  40.87 
 
 		 406 aa  325  7e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  39.38 
 
 		 396 aa  325  8.000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  40.05 
 
 		 405 aa  325  9e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  39.32 
 
 		 391 aa  325  1e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1794  succinyldiaminopimelate transaminase  38.3 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  40.41 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  39.74 
 
 		 397 aa  323  5e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1447  aminotransferase class I and II  39.03 
 
 		 398 aa  322  5e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0506  aminotransferase  41.09 
 
 		 406 aa  322  9.000000000000001e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0194715  normal  0.65304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  39.64 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  39.58 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  39.47 
 
 		 397 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>