More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1678 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  100 
 
 		 474 aa  938    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  58.96 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  56.64 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  47.36 
 
 		 400 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  48.06 
 
 		 407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  47.96 
 
 		 406 aa  332  9e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  43.68 
 
 		 409 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  43.67 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  43.67 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  42.33 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  42.33 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  42.24 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  43.68 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1730  major facilitator superfamily MFS_1  44.41 
 
 		 415 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1602  major facilitator superfamily MFS_1  44.68 
 
 		 397 aa  239  9e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.822516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1767  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18145 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2610  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1847  transporter protein  46.31 
 
 		 188 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1846  transporter protein  38.51 
 
 		 229 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.958956  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  27.87 
 
 		 386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 383 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  25 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  26.91 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 387 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 420 aa  97.8  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.3 
 
 		 621 aa  93.6  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2581  membrane transport protein  33.86 
 
 		 404 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324578  normal  0.102072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 416 aa  92.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  27.82 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 391 aa  87  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.38 
 
 		 421 aa  87  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  27.78 
 
 		 394 aa  86.7  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0322  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  26.09 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.48 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1857  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.906774  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1199  putative multidrug transporter  22.89 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467724  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1574  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 565 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000345614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 461 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4530  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 393 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516795  normal  0.212177 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  22.02 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  25.33 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  30.81 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  25.33 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.3 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.98 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  31.02 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  25.2 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 474 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.7 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.43 
 
 		 478 aa  79.7  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.7 
 
 		 479 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.13 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  29.13 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2020  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34408 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  29.13 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.6 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.57 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.13 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.33 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0658  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  26.11 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  23.52 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  23.36 
 
 		 537 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2618  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.876226 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0747  major facilitator superfamily transporter  37.35 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  25.78 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.13 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0650  major facilitator family transporter  26.42 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  23.36 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.13 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  31.71 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03383  conserved hypothetical protein  32.41 
 
 		 579 aa  77  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>