More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1637 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  48.23 
 
 		 838 aa  744    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  48.23 
 
 		 835 aa  745    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  44.18 
 
 		 862 aa  692    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  44.01 
 
 		 872 aa  677    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  58.12 
 
 		 848 aa  1021    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  100 
 
 		 847 aa  1738    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  39.2 
 
 		 810 aa  618  1e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  39.15 
 
 		 886 aa  594  1e-168  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  40.02 
 
 		 839 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  42.51 
 
 		 836 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  38.01 
 
 		 783 aa  514  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  35.33 
 
 		 835 aa  505  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  36.16 
 
 		 783 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  36.04 
 
 		 783 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  36.29 
 
 		 835 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  35.45 
 
 		 837 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  35.4 
 
 		 783 aa  449  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  35.66 
 
 		 823 aa  446  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  35.16 
 
 		 832 aa  436  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  35.19 
 
 		 852 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  34.55 
 
 		 828 aa  427  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  33.99 
 
 		 847 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  36.76 
 
 		 839 aa  423  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  33.6 
 
 		 877 aa  421  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  35.45 
 
 		 840 aa  407  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  32.28 
 
 		 817 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  33.22 
 
 		 841 aa  402  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  33.52 
 
 		 825 aa  392  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  32.31 
 
 		 873 aa  386  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  35.03 
 
 		 835 aa  382  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  35.6 
 
 		 805 aa  373  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  32.82 
 
 		 843 aa  362  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  31.05 
 
 		 833 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  34.4 
 
 		 767 aa  356  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  32.78 
 
 		 851 aa  352  2e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  33.78 
 
 		 818 aa  351  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  30.98 
 
 		 826 aa  348  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  30.73 
 
 		 826 aa  345  2.9999999999999997e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  30.06 
 
 		 878 aa  333  8e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  30.6 
 
 		 834 aa  325  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  32.1 
 
 		 792 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  33.24 
 
 		 790 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  32.01 
 
 		 792 aa  308  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  31.34 
 
 		 822 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  33 
 
 		 790 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  30.92 
 
 		 723 aa  303  6.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  32.65 
 
 		 790 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  29.86 
 
 		 716 aa  297  7e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  35.16 
 
 		 790 aa  292  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  33.61 
 
 		 655 aa  288  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  29.24 
 
 		 736 aa  283  9e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  35.01 
 
 		 667 aa  283  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  42.17 
 
 		 696 aa  280  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  32.49 
 
 		 722 aa  280  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  40.42 
 
 		 404 aa  279  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  36.63 
 
 		 407 aa  274  6e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  38.18 
 
 		 419 aa  271  5e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  38.57 
 
 		 746 aa  269  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  39.39 
 
 		 411 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14790  peptidase U32  45 
 
 		 667 aa  267  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  36.1 
 
 		 409 aa  267  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  36.1 
 
 		 409 aa  267  7e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  31.15 
 
 		 640 aa  266  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  37.38 
 
 		 411 aa  265  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0995  peptidase U32  28.9 
 
 		 876 aa  263  8e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  36.25 
 
 		 406 aa  263  8.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  31.73 
 
 		 629 aa  263  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  35.89 
 
 		 422 aa  261  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  35.89 
 
 		 422 aa  261  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  33.02 
 
 		 637 aa  260  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2383  peptidase U32  32.16 
 
 		 662 aa  260  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000437173 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  38.56 
 
 		 403 aa  260  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  40.78 
 
 		 422 aa  259  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  37.99 
 
 		 430 aa  259  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  38.22 
 
 		 404 aa  259  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  32.27 
 
 		 621 aa  259  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0882  peptidase U32  33.51 
 
 		 652 aa  258  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  40.22 
 
 		 406 aa  257  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  38.1 
 
 		 422 aa  257  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3259  peptidase, U32 family  30.93 
 
 		 668 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  42.95 
 
 		 404 aa  255  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  31.01 
 
 		 654 aa  255  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  30.88 
 
 		 653 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  33.27 
 
 		 639 aa  254  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  31.01 
 
 		 654 aa  254  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  31.01 
 
 		 654 aa  254  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  31.01 
 
 		 654 aa  254  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3086  peptidase U32  31.61 
 
 		 669 aa  254  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193528  normal  0.252382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  31.01 
 
 		 654 aa  254  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  40.77 
 
 		 410 aa  254  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  36.39 
 
 		 427 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0764  peptidase U32  32 
 
 		 649 aa  253  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  31.4 
 
 		 672 aa  253  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  30.72 
 
 		 653 aa  252  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  30.72 
 
 		 653 aa  252  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  30.72 
 
 		 667 aa  252  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  30.6 
 
 		 668 aa  252  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  30.72 
 
 		 667 aa  252  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  30.72 
 
 		 653 aa  252  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  30.72 
 
 		 667 aa  252  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>