216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1625 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
544 aa  1107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  64.77 
 
 
545 aa  729  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  37.81 
 
 
553 aa  363  4e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  36.48 
 
 
570 aa  336  8e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.15 
 
 
550 aa  329  8e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  1.41365e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  34.48 
 
 
598 aa  326  6e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  34.45 
 
 
594 aa  316  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  34.54 
 
 
559 aa  315  2e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  34.18 
 
 
525 aa  293  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.27 
 
 
580 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.74 
 
 
350 aa  252  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.29 
 
 
339 aa  240  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  37.91 
 
 
325 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  37.61 
 
 
325 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  1.23897e-06 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  30.31 
 
 
558 aa  221  2e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  38.76 
 
 
333 aa  221  2e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  2.17029e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  36.12 
 
 
325 aa  221  4e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  37 
 
 
339 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  39.23 
 
 
339 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  36.72 
 
 
325 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  37.72 
 
 
339 aa  209  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.52 
 
 
341 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  38.51 
 
 
326 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  34.22 
 
 
346 aa  206  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  36.83 
 
 
339 aa  206  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.83 
 
 
344 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  35.31 
 
 
343 aa  204  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.72 
 
 
343 aa  203  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  35.29 
 
 
343 aa  202  1e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.39 
 
 
343 aa  202  2e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  36.5 
 
 
343 aa  201  2e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.83 
 
 
333 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  34.42 
 
 
343 aa  200  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  37.39 
 
 
343 aa  198  2e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  34.22 
 
 
727 aa  198  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.39 
 
 
344 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.78 
 
 
344 aa  195  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  33.73 
 
 
344 aa  195  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.31 
 
 
343 aa  194  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  33.43 
 
 
344 aa  193  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.72 
 
 
343 aa  193  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  33.63 
 
 
731 aa  192  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.43 
 
 
731 aa  191  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  32.65 
 
 
346 aa  188  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.88 
 
 
343 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.4 
 
 
350 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.24 
 
 
334 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  32.33 
 
 
334 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 
329 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  34.4 
 
 
346 aa  186  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  34.4 
 
 
344 aa  186  1e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.82 
 
 
342 aa  185  2e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.43 
 
 
338 aa  184  4e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.75 
 
 
330 aa  183  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.94 
 
 
344 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  32.94 
 
 
342 aa  181  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  36.31 
 
 
344 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  31.76 
 
 
343 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.93 
 
 
332 aa  174  4e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.09 
 
 
343 aa  174  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.03 
 
 
332 aa  173  7e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  31.66 
 
 
343 aa  173  7e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.94 
 
 
342 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  31.64 
 
 
336 aa  171  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  32.64 
 
 
336 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  32.55 
 
 
343 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  30.82 
 
 
330 aa  165  2e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.54 
 
 
331 aa  164  5e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  34.24 
 
 
323 aa  162  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.86 
 
 
347 aa  161  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.7 
 
 
347 aa  157  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  30.67 
 
 
330 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  31.07 
 
 
331 aa  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.99 
 
 
331 aa  154  3e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.6 
 
 
330 aa  154  3e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 
323 aa  154  3e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  31.65 
 
 
330 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  30.24 
 
 
331 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  29.14 
 
 
331 aa  151  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  30.49 
 
 
331 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  31.12 
 
 
330 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.71 
 
 
330 aa  150  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  28.23 
 
 
330 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  28.96 
 
 
331 aa  148  2e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.27 
 
 
333 aa  148  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  29.84 
 
 
330 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  2.47044e-06 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  39.59 
 
 
207 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.14 
 
 
329 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  29.08 
 
 
333 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.56 
 
 
331 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  31.65 
 
 
337 aa  144  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.08 
 
 
330 aa  142  2e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1289  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.56 
 
 
306 aa  141  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  28.96 
 
 
330 aa  141  4e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.87 
 
 
330 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  27.71 
 
 
326 aa  139  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  29.2 
 
 
333 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.14 
 
 
337 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.47 
 
 
338 aa  138  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.65 
 
 
319 aa  137  6e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>