More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1612 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01688  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 642 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1923  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 642 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000181503  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10531  threonyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 638 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.487806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 639 aa  692    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 636 aa  740    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 640 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 635 aa  1318    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 640 aa  681    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 638 aa  729    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 635 aa  665    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 635 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 640 aa  753    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 645 aa  649    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  55.35 
 
 		 637 aa  719    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 635 aa  711    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2597  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 645 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000186587  hitchhiker  0.000386738 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 635 aa  697    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 638 aa  716    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 640 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 639 aa  756    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 645 aa  649    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 639 aa  753    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 645 aa  649    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 639 aa  757    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 645 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 635 aa  697    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 637 aa  677    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 637 aa  676    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 640 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 644 aa  651    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  51.02 
 
 		 638 aa  674    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 641 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 635 aa  680    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 635 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 637 aa  665    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 640 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 635 aa  697    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 635 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 644 aa  701    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1415  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 660 aa  643    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000939714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  71.56 
 
 		 635 aa  968    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 638 aa  707    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 635 aa  692    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 640 aa  646    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 641 aa  665    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 640 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2859  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 639 aa  653    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.248456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 645 aa  736    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  54.5 
 
 		 644 aa  717    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 642 aa  685    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 639 aa  756    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 645 aa  649    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3089  threonyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 		 639 aa  659    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345995  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 640 aa  740    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 638 aa  665    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 643 aa  653    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  68.83 
 
 		 633 aa  934    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 635 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 636 aa  701    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 640 aa  730    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 		 645 aa  733    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0942  threonyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 642 aa  643    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484442  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 640 aa  683    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  52.81 
 
 		 669 aa  713    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 636 aa  680    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 640 aa  643    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  54.02 
 
 		 635 aa  721    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 		 635 aa  699    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 		 635 aa  683    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1705  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 642 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0371819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 643 aa  651    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1799  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  47.78 
 
 		 632 aa  636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302616  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 644 aa  708    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 644 aa  649    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 635 aa  685    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 		 659 aa  668    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1724  threonyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 642 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116827  normal  0.392039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1319  hypothetical protein  57.09 
 
 		 586 aa  679    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 635 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1873  threonyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 681 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0629809 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2499  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 638 aa  640    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0219257  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 635 aa  648    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02079  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 642 aa  653    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 640 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1937  threonyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 642 aa  636    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1800  threonyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 642 aa  636    Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000021107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  58.38 
 
 		 584 aa  737    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 641 aa  698    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 644 aa  671    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  70.24 
 
 		 635 aa  947    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 644 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  51.97 
 
 		 635 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 640 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 635 aa  697    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 635 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 644 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 648 aa  695    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 643 aa  685    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 636 aa  731    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 635 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>