More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1602 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.04 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  37.1 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  41.04 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  32.11 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  32.28 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.28 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  32.28 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  32.28 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  32.28 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  32.28 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  32.11 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  32.11 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  32.11 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  31.75 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  34.57 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  31.8 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  36.81 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  32.11 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  30.49 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  33.15 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  27.16 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  26.7 
 
 		 267 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1038  SNARE associated Golgi protein  29.51 
 
 		 197 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  26.06 
 
 		 253 aa  85.5  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  32.24 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  32.24 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  32.24 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  32.24 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  32.24 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  32.24 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  32.24 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  32.24 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  32.24 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  29.38 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0857  SNARE associated Golgi protein  29.26 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0125734  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  25.99 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.74 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3348  hypothetical protein  30.32 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  26.58 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  28.49 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  28.14 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  36.5 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  34.42 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.25 
 
 		 713 aa  75.9  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2616  SNARE associated Golgi protein  32.12 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  35.21 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  31.36 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0668  hypothetical protein  32.19 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  32.09 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  31.75 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  29.55 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  27.78 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0728  hypothetical protein  32.19 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.38 
 
 		 717 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0872  SNARE associated Golgi protein  26.84 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1854  hypothetical protein  27.17 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  31.39 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  27.78 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  30.08 
 
 		 735 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  27.78 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  30.2 
 
 		 209 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  30.2 
 
 		 209 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  30.32 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  27.78 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  31.36 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  30.6 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2523  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.95 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.78 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  28.73 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  27.81 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  27.78 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  31.58 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  31.82 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  37.61 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.46 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  30.5 
 
 		 722 aa  70.1  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0013  hypothetical protein  34.91 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  30.08 
 
 		 732 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  30.86 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.66 
 
 		 701 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  29.2 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  29.27 
 
 		 732 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  29.27 
 
 		 732 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0510  hypothetical protein  37.17 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00856705  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0639  hypothetical protein  37.93 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  27.98 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  33.1 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  32.52 
 
 		 728 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0515  SNARE associated Golgi protein  37.07 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0568  hypothetical protein  36.28 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0512  hypothetical protein  37.07 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000166734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0600  hypothetical protein  36.28 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  30.97 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  29.94 
 
 		 704 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  32.52 
 
 		 728 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  25.71 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>