More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1586 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 328 aa  661    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  52.46 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  38.44 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  36.36 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  33.64 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  37.59 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  33.13 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  34.1 
 
 		 333 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  34.69 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  33.56 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  30.58 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  30.58 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  32.88 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  30.25 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  30.42 
 
 		 342 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  30.19 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  32.65 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  33.11 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  28.34 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  31.07 
 
 		 331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  31.07 
 
 		 331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  31.07 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  31.07 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  31.07 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  29.48 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  29.13 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5637  hypothetical protein  34.42 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  31.06 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  31.06 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  31.37 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  31.37 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  31.37 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  31.37 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  31.37 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  31.37 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  31.37 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  31.37 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  30.38 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  31.05 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  28.86 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  28.66 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1110  putative ABC transport system, lipoprotein  30.69 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  30.87 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  28 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  29.64 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.53 
 
 		 500 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  26.25 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  28.52 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  30.34 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  28.44 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  29.63 
 
 		 339 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  27.39 
 
 		 344 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  29.55 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  24.48 
 
 		 425 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  29.1 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  30.87 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2916  secretion protein HlyD family protein  30.26 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  34.47 
 
 		 541 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  25.54 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  27.91 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  27.54 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  37.76 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  37.57 
 
 		 541 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  28.21 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  25.54 
 
 		 281 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  28.21 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  28.21 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  30.06 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  28.03 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  26.89 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  27.43 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  28.37 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.21 
 
 		 355 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  27.52 
 
 		 326 aa  105  7e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  27.05 
 
 		 350 aa  105  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  28.88 
 
 		 359 aa  105  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  38.89 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  29.52 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  26.1 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  28.09 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0123  hypothetical protein  29.38 
 
 		 310 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  30.99 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  26.59 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  27.42 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  30.18 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  29.17 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  26.69 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.94 
 
 		 505 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  28.06 
 
 		 346 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  29.75 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  27.19 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  27.84 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  28.37 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  28.48 
 
 		 377 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  30.38 
 
 		 509 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  25.96 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>