69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1567 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1567  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  493  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1996  protein of unknown function DUF541  56.28 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.278766 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1997  hypothetical protein  51.06 
 
 		 261 aa  253  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0472  protein of unknown function DUF541  49.17 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000443999  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10868  hypothetical protein  40.42 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1796  hypothetical protein  37.45 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.193183  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1832  hypothetical protein  37.45 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0356  hypothetical protein  37.5 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.187061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2326  hypothetical protein  33.61 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2255  protein of unknown function DUF541  32.49 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0374125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0957  hypothetical protein  34.3 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17101  periplasmic protein  34.89 
 
 		 259 aa  128  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04251  periplasmic protein  32.92 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04361  periplasmic protein  31.8 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0370  putative periplasmic protein  31.67 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03216  hypothetical protein  29.55 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000893493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0525  hypothetical protein  31.1 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426488  normal  0.0754297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0087  hypothetical protein  31.84 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1748  hypothetical protein  32.9 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2109  protein of unknown function DUF541  31.5 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00837  hypothetical protein  31.9 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1395  hypothetical protein  29.15 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  unclonable  0.0000000000143355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1460  hypothetical protein  29.15 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000634241  unclonable  0.0000276255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3101  hypothetical protein  28.64 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001628  putative periplasmic protein  30.84 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2301  hypothetical protein  31.22 
 
 		 238 aa  92  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1448  hypothetical protein  28.38 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000347149  unclonable  0.0000000000712925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3039  hypothetical protein  28.12 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0172868  normal  0.01799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2412  hypothetical protein  28.64 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2472  hypothetical protein  28.64 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000142  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2154  hypothetical protein  29.11 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1109  hypothetical protein  28.5 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3473  hypothetical protein  29.13 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1910  protein of unknown function DUF541  26.54 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2793  hypothetical protein  27.27 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000363399  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0569  protein of unknown function DUF541  29.72 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0339808  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2773  hypothetical protein  26.79 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000968246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1585  protein of unknown function DUF541  26.79 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000124406  hitchhiker  0.000000000106275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2868  hypothetical protein  26.79 
 
 		 238 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000991605  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0072  hypothetical protein  28.71 
 
 		 233 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0108792  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2438  hypothetical protein  27.57 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000355318  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0048  hypothetical protein  28.18 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.411196  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0033  hypothetical protein  28.71 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1140  hypothetical protein  29.76 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2080  protein of unknown function DUF541  25.68 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3038  hypothetical protein  26.09 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2104  hypothetical protein  27 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1426  hypothetical protein  24.88 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.174066 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K09  hypothetical protein  24.62 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1616  hypothetical protein  23.35 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  decreased coverage  0.000000163604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2180  hypothetical protein  25.67 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000267555  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2487  hypothetical protein  26.48 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.375164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  25.3 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  27.27 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  26.5 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  23.7 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  23.96 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  25.75 
 
 		 246 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  28.66 
 
 		 264 aa  45.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16340  hypothetical protein  22.6 
 
 		 167 aa  45.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1773  hypothetical protein  23.15 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2145  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00597669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2333  hypothetical protein  20.77 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0753305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  26.99 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  23.37 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  27.46 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  30.1 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  26.11 
 
 		 242 aa  42  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>