More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1521 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 309 aa  627  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  62.98 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  61.27 
 
 		 315 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  54.51 
 
 		 307 aa  309  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  52.45 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  47.71 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  46.41 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  46.36 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  46.73 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  51.79 
 
 		 285 aa  269  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  50 
 
 		 307 aa  269  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  47.13 
 
 		 327 aa  263  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  48.4 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  51.93 
 
 		 285 aa  262  6e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  46.88 
 
 		 328 aa  252  7e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  44.67 
 
 		 310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  36.24 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  35.13 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  37.14 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  36.92 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  37.77 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  37.4 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  36.08 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  36.58 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  34.86 
 
 		 305 aa  175  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  33.81 
 
 		 330 aa  175  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  32.58 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  33.58 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  34.47 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  33.57 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  34.45 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 295 aa  168  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  33.92 
 
 		 312 aa  168  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  34.62 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  32.88 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  35.09 
 
 		 332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  32.08 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  35.61 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  35.61 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  33.21 
 
 		 317 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  32.26 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  35.83 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  31.82 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  34.12 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  31.45 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  32.87 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  33.8 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00146  ferrous iron efflux protein F  32.37 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  33.8 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  31.88 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  34.89 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  36.7 
 
 		 314 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  34.04 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 		 481 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  34.19 
 
 		 339 aa  152  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  30.97 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  31.07 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  33.96 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  33.96 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 459 aa  149  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  29.97 
 
 		 326 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  30 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  31.94 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  33.45 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  27.62 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  33.58 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  32.07 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  30.85 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  31.94 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  35.06 
 
 		 460 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  32.34 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 		 460 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  32.36 
 
 		 301 aa  145  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 		 476 aa  144  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  32.82 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  33.08 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  31.09 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  31.09 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  30.66 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  30.04 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  30.71 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  30.83 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  31.72 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  33.97 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  30.59 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  32.39 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  27.04 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  29.22 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  29.08 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  29.08 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  29.08 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  29.08 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  29.08 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>